SYTO 9 Green Fluorescent Nucleic Acid Stain (5 mM in DMSO)  绿色荧光核酸染料

SYTO 9;PI 碘化丙啶;Propidium Monoazide (PMA) 叠氮溴化丙锭;SYTO 9/PI Live/Dead Bacterial Double Stain Kit 活细菌/死细菌双染试剂盒;活死细菌染色;

温馨提示1):若需做双染,可配合购买我司的碘化丙啶PI(MX4205-10MG,MX4205-1ML)。

温馨提示2):若需做双染,亦可直接购买我司的SYTO 9/PI Live/Dead Bacterial Double Stain Kit 活细菌/死细菌双染试剂盒(MX4234-40T)。

产品描述

SYTO 9绿色荧光核酸染料(SYTO 9 Green Fluorescent Nucleic Acid Stain),是一款优秀的绿色荧光细胞核和染色体复染剂,能渗透进入原核和真核细胞膜。SYTO 9高亲和结合DNA(以及RNA),一旦结合后呈现明显增强的荧光信号,最大激发和发射波长分别是483nm和503nm。SYTO 9极其适合用作细菌实验的核复染剂,因其对革兰氏阳性菌和阴性菌的活细胞和死细胞都能染色。SYTO 9常常与碘化丙啶(PI)联合使用,用于活/死细菌染色。

本品以DMSO储存液形式提供,浓度为5mM。只需用合适的生理缓冲液稀释到工作浓度进行简单孵育即可。适用于哺乳动物细胞、革兰氏阳性和革兰氏阴性菌。

产品特性

1) 同义名:SYTO 9 Green dye;SYTO 9绿色荧光染料;

2) 外观:橙色溶液

3) 荧光特征:EX/Em=485/498nm(与DNA结合);EX/Em=486/501nm(与RNA结合)

图1. SYTOX 9与核酸结合的光谱特征。A)与DNA结合的吸收光谱;B)与RNA结合的吸收光谱;C)与DNA或RNA结合后的荧光发射光谱。

4) 渗透性:细胞通透性

保存与运输方法

保存:-20℃避光保存,至少1年有效。

运输:冰袋运输。

注意事项

1)荧光探针均存在淬灭问题,请尽量注意避光,以减缓荧光淬灭。

2) 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作

将低温保存的PMA粉末置于室温回温至少20min,低速离心使粉末沉至管底。避光条件下加入98μl无菌水,充分溶解混匀,即得到20mM储存液。储存液根据单次用量分装,-20℃避光冻存,至少6个月有效。

应用示例(来自文献,仅作参考)

Ref 1)Yagüe P, Manteca A, Simon A, Diaz-Garcia ME, Sanchez J. New method for monitoring programmed cell death and differentiation in submerged Streptomyces cultures. Appl Environ Microbiol. 2010;76(10):3401-3404. doi:10.1128/AEM.00120-10

实验目的:建立一种简单和可靠得方法来监测和定量链霉素发酵物的细胞死亡过程,使用活细胞染料SYTO 9和碘化丙啶PI。使用原理在于:SYTO 9是一种细胞膜渗透性的核酸染料,能够标记所有细胞:具膜完整性和受损的细胞膜。PI只能渗透进入膜不完整的细菌。因此,在混合细菌群内,具完整细胞膜的细菌呈绿色荧光,而破损膜结构的细菌呈红色;

Fig. S. coelicolor growth curve and antibiotic (actinorhodin and undecylprodigiosin) production in submerged cultures. Confocal microscope images of key developmental stages stained with SYTO 9 and PI are shown at the top: individual hyphae of the first compartmentalized mycelium (MI; arrows indicate septation), second multinucleated mycelium hyphae (MII), and the mycelial pellet (240 μm in diameter) undergoing PCD processes in the center (red). The transitory growth arrest phase coinciding with PCD is indicated. See text for details.

Ref 2)Robertson J, McGoverin C, Vanholsbeeck F and Swift S (2019) Optimisation of the Protocol for the LIVE/DEAD® BacLightTM Bacterial Viability Kit for Rapid Determination of Bacterial Load. Front. Microbiol. 10:801. doi: 10.3389/fmicb.2019.00801

实验方法(SYTO 9+PI染色):用棕色离心管稀释SYTO 9和PI使其浓度分别为33.4和400 μM,置于冰上保存。分别加50 μl SYTO 9和50 μl PI工作液和/或0.85%生理盐水(总体积为100μl)到0.9ml培养物内,使得SYTO 9和PI 的浓度分别为1.67和20 μM。对于基本培养基的优化实验,每一组活细胞和死细胞悬液分别用SYTO 9, PI和SYTO 9+PI染色。

Fig. Live/dead spectrometry on live and dead E. coli suspensions in minimal media and saline. SYTO 9 intensity in minimal media (A), PI intensity in minimal media (B), proportion of live cells in minimal media derived from the kit ratio (C), % live cells in minimal media derived from the adjusted dye ratio (D), the proportion of live cells in saline derived from the kit ratio (E) and % live cells in saline derived from the adjusted dye ratio (F) for live and dead E. coli suspensions derived from integrating at three different wavelength ranges for each dye. An R2-value was generated from a linear regression analysis of data from each wavelength range. Data presented is the median with the range from six biological replicates.

染色流程

基于实验室经验和发表方法,建议使用广谱的染色浓度来开展使用,并且根据自身的细胞类型和实验体系来优化摸索出最佳的工作浓度(见表2)

使用塑料管来稀释SYTO 9染料,由于稀释后的染料会粘附到玻璃上。总的来说,用不含磷酸盐的缓冲液来染色能得到最好的结果。塑料或玻璃器皿上残留的去污剂也有可能影响许多细胞或有机体的真实染色,导致在含或不含细胞的溶液中都能看到发明亮荧光的材料。确保用温和去污剂来清洗玻璃器皿,用热自来水完全冲洗干净,最后用去离子水清洗数次。

表2. SYTOX 9染色不同细胞的建议工作浓度
细胞类型 SYTOX 9浓度 孵育条件
细菌细胞 50 nM-20 µM 涡旋混匀,之后孵育1-30 min
真核细胞 10 nM-5 µM 孵育10-120 min 
微阵列 (Microarrays) 50 nM in TE buffer 孵育5 min,清洗之后晾干

①离心收集细胞,用生理盐溶液或水重悬细胞。贴壁细胞(比如:哺乳动物细胞)可能在盖玻片上原位染色。使用表2内建议的工作浓度进行染色。初次实验,建议在建议浓度范围内做多个染料浓度,以确定能得到最佳染色的工作浓度。需要注意:生长培养基、细胞密度、是否存在其它细胞、和其它因素都可能影响染色。

②染色的真核细胞通常显示出弥散的细胞浆染色和细胞核染色,特别是经常看到明亮的核内小体染色。由于此染料具细胞膜渗透性,且中性pH下带净正电荷,也有可能染线粒体。活酵母菌内主要是线粒体染色。

相关产品

名称 规格
SYTOX Green Nucleic Acid Stain (5 mM in DMSO)  50µl
SYTO 9 Green Fluorescent Nucleic Acid Stain (5 mM in DMSO) 20µl
Propidium Iodide 碘化丙啶(粉末) 10mg
DAPI 细胞核探针 10mg
Ethidium Monoazide Bromide (EMA) 叠氮溴化乙锭 5mg
Propidium Monoazide (PMA) 叠氮溴化丙锭 1mg
SYTO 9/PI Live/Dead Bacterial Double Stain Kit 活细菌/死细菌双染试剂盒 40T

 

SYTO 9/PI Live/Dead Bacterial Double Stain Kit 活细菌/死细菌双染试剂盒

SYTO 9绿色荧光染料;Propidium Iodide(PI)碘化丙啶;活/死细菌双染试剂盒;SYTOX Green 死细胞绿色荧光染料;

产品信息

产品名称

规格

SYTO 9/PI Live/Dead Bacterial Double Stain Kit 活细菌/死细菌双染试剂盒

40T

SYTO 9/PI Live/Dead Bacterial Double Stain Kit 活细菌/死细菌双染试剂盒 80T

试剂盒规格说明(以MX4234-40T为例,按照建议的试剂稀释倍数和单次测试体积来计算):

◇ 荧光显微镜检测,1ml菌液加入3μl染料混合液(SYTO 1.5μl +PI 1.5μl),可做40次独立测试。

◇ 荧光酶标仪检测,2ml无菌水加入12μl染料混合液(SYTO 6.0μl +PI 6.0μl),制备成2×工作液。按照100μl染料混合液加入100μl菌液的比例使用,可做200次独立测试。

◇ 流式细胞仪检测,2ml菌液加入6μl染料混合液(SYTO 3.0μl +PI 3.0μl),可做20次独立测试。

产品描述

活细菌/死细菌双染试剂盒(SYTO 9/PI Live/Dead Bacterial Double Stain Kit)是一款方便且操作简单的试剂盒,利用SYTO 9绿色核酸染料和碘化丙啶(PI)红色荧光核酸染料来进行细菌活力的检测,适用于大量的细菌种属,包括蜡样芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、产气荚膜杆菌、大肠杆菌、肺炎克雷伯氏菌、草分枝杆菌、绿脓杆菌、金黃葡萄球菌、奥拉尼堡沙门氏菌、宋内志贺氏菌和化脓性链球菌。

本试剂盒的工作原理在于:SYTO 9和PI的光谱特征以及穿透健康细菌细胞的能力不同。单独使用时,SYTO 9能对群体内的所有细菌进行标记—具有完整膜和受损膜的细菌;相反,PI只能渗透进入受损的膜,PI的插入会引起SYTO 9染色荧光的降低,当体系内加入两种染料时。因此,通过适量比例的SYTO 9和PI的混合染色,具有完整膜结构的细菌呈绿色荧光,而具受损膜结构的细菌呈红色荧光。两者染料的最大激发和发射波长分别是480/500nm(SYTO 9)和 490/635nm(PI)。背景基本无荧光。本试剂盒兼容于荧光显微镜,荧光光度计、荧光酶标仪、流式细胞仪或其它荧光检测仪器。

试剂盒组分

编号

组分 保存方法 产品编号/规格

40T

80T

A

SYTO 9 Solution (3.34mM) -20ºC避光 60μl 2×60μl
B PI Solution(20mM) -20ºC避光 60μl

2×60μl

C Mounting oil, for bacteria immobilized on membranes -20ºC保存 2ml

2×2ml

保存与运输方法

保存:-20℃避光保存,有效期一年。 

运输:冰袋运输。

注意事项

  • 由于试剂盒内SYTO 9和PI的组分量少,室温回温充分融化后,务必低速离心沉至管底后再开盖。
  • 第一次使用可将SYTO 9和PI根据单次用量分装保存,密封后置于≤-20℃避光保存。
  • 组分C(Mounting oil)用于将细菌固定在膜上,25℃的折射率是517 ± 0.003。不要用作浸油(Immersion oil)。
  • SYTO 9和PI结合核酸,PI是潜在的诱变剂,目前没有数据阐明SYTO 9的诱变性或毒性,两种试剂使用都需做恰当防护。DMSO能促进有机分子进入组织。强烈建议处理DMSO储存液时戴双层手套。对于核酸染料,含此类染料的试剂经活性炭吸附后再进行废液处理。活性炭之后经焚烧来破坏染料。
  • 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

使用方法

以下步骤仅用作示例以指导科研人员开展自身细菌样本的染色。

一、培养条件和细菌悬液的制备

【注意】:用本试剂盒进行细菌染色,务必要小心去除培养基残留,因为,核酸和其它培养基成分可能以不可预料的方式与SYTO 9和PI结合,导致染色结果发生不可接受的变动。简单的一次清洗步骤通常足以去除培养基内含的培养基成分干扰物残留。不建议使用磷酸盐清洗缓冲液,因此可能降低染色效率。

1.1 用营养肉汤培养大肠杆菌或金黄色葡萄球菌(30ml)使其生长至对数生长后期。

1.2 于10000×g离心10-15min,浓缩25ml细菌培养物。

1.3 吸走上清液,用2ml 0.85% NaCl或适当缓冲液来重悬沉淀。

1.4 取1ml重悬菌液分别加入含20ml 0.85% NaCl或适当缓冲液的30-40ml离心管(用作活细菌),或含20ml 70%异丙醇的30-40ml离心管(用作杀死细菌)。

1.5 两管样品于室温孵育1h,每隔15min颠倒混匀一次。

1.6 两管样品于10000×g离心10-15min。

1.7 用20ml 0.85% NaCl或适当缓冲液重悬沉淀,并且按照步骤1.6再离心一次。

1.8 分别用10ml 0.85% NaCl或适当缓冲液重悬两管样品。

1.9 分别取3ml菌液测定670nm的光密度(OD670),用玻璃或丙烯酸酯比色皿(1cm路径)。

1.10 对于大肠杆菌或金黄色葡萄球菌的建议染色浓度,根据你的仪器类型(荧光显微镜、荧光光度经、荧光酶标仪)或流式细胞仪来参考相应部分的染色条件。

染色条件的优化

试剂盒内的两种染料都经过平衡优化,按照1:1的比例进行混合用于绝大多数的样本都能得到良好的区分活/死细菌。偶然情况下,两种染料的混合比例需根据实际需求进行优化调整。比如:在待检样本中,绿色荧光太突出,建议要么降低SYTO 9浓度,要么提高PI浓度。

为了全面优化染色条件,建议测试梯度浓度的SYTO 9,每一种浓度与梯度浓度的PI进行组合染色。建议按照1ml细菌悬液加入3µl不同混合比率的染料预混液。

荧光显微镜操作步骤

活菌和死菌的荧光可能用标准的荧光素长通滤片设置来同时观察。替代方案的话,活菌(绿色荧光)和死菌(红色荧光)可分别用荧光素和Texas Red带通滤光片设置。用于本试剂盒检测的建议荧光显微镜滤片设置见表1。

表1 适用于本试剂盒检测用的常见滤光片特征

Omega滤光片* Chroma滤光片* 注意事项
XF25, XF26, XF115 11001, 41012, 71010 用于同时观察SYTO 9和PI染色的长通和双发射滤光片
XF22, XF23 31001, 41001 仅用于观察SYTO 9的带通滤光片
XF32, XF43, XF102, XF108 31002, 31004, 41002, 4100 仅用于观察PI的带通滤光片
*:用于荧光显微镜观察的推荐带通滤光片。Omega滤光片由Omega Optical提供,Chroma滤光片由Chroma Technology公司提供。

3.1 在微量离心管内组合等量的组分A(SYTO 9)和组分B(PI),混匀。

3.2 每1ml细菌悬液内加入3μl染料预混液。按照建议的稀释倍数,最终得到的染色工作液内含0.3% DMSO。更高浓度的DMSO可能对染色产生副效果。

3.3 混匀后室温避光孵育15min。

3.4 吸5μl染色的细菌悬液到载玻片上,并盖上18mm方形盖玻片。

3.5 根据表1选择荧光显微镜上合适的滤片来观察。

荧光光度计操作步骤

4.1 调整大肠杆菌悬液(活和杀死)使其密度为1×108个细菌/ml(~0.03 OD670)或金黄色葡萄球菌悬液(活和杀死)使其密度为1×107个细菌/ml(~0.15 OD670)。用于荧光光度计检测,金黄色葡萄球菌悬液的浓度通常比大肠杆菌少10倍。

4.2 参考表2在1cm 玻璃、丙烯酸酯或石英荧光比色皿混匀五种不同比例的细菌悬液。每个样本的总体积为3ml。

表2. 荧光光度计法检测活/死细菌所需不同比例活细菌和死细菌悬液的加量体积

活:死细菌比例 ml 活细菌悬液 ml 死细菌悬液
0:100 0 3.0
10:90 0.3 2.7
50:50 1.5 1.5
90:10 2.7 0.3
100:0 3.0 0

4.3 在微量离心管内分别加30μl组分A(SYTO 9)和30μl组分B(PI),混匀。

4.4 每组不同比例的细菌悬液内加入9μl染料预混液(5个样本×9μl =45μl总量),用枪上下吹打数次使其混匀。

4.5 室温避光孵育15min。

4.6 荧光测定和数据分析

①用荧光光度计测定每组细菌悬液(Fcell)的荧光发射光谱(激发:470nm,发射:490-700nm);

②分别测定发射光谱在510-540nm(em1,绿色)和620-650nm(em2,红色)的累积荧光,并计算累积荧光比值:RatioG/R=Fcell,em1/Fcell,em2

③以大肠杆菌悬液内活细胞的占比为横坐标,以累积绿色荧光与红色荧光比(RatioG/R)为纵坐标,制图。

荧光酶标仪操作步骤

针对细菌悬液,用荧光酶标仪的测定条件与荧光光度计的基本类似。如同荧光光度计的检测步骤,染料浓度相同于荧光显微镜的建议浓度,绿/红荧光比与活细菌相对数量呈正比。

5.1 调整大肠杆菌悬液(活和杀死)使其密度为2×108个细菌/ml(~0.06 OD670)或金黄色葡萄球菌悬液(活和杀死)使其密度为2×107个细菌/ml(~0.3 OD670)。用于荧光酶标仪检测,金黄色葡萄球菌悬液的浓度通常比大肠杆菌少10倍。

5.2 参考3在16×125mm高硼硅玻璃培养管内混匀五种不同比例的细菌悬液(大肠杆菌或金黄色葡萄球菌)。每个样本的总体积为2ml。

3. 荧光酶标仪法检测活/死细菌所需不同比例活细菌和死细菌悬液的加量体积

活:死细菌比例 ml 活细菌悬液 ml 死细菌悬液
0:100 0 2.0
10:90 0.2 1.8
50:50 1.0 1.0
90:10 1.8 0.2
100:0 2.0 0

5.3 在微量离心管内分别加6μl组分A(SYTO 9)和6μl组分B(PI),混匀。

5.4 通过将所有的12μl上述预混液加入2ml无菌的dH2O,混匀后制备2×染色混合液。

5.5 吸100μl细菌悬液混合物到平底96孔板的各孔内,建议每个制备物做三个平行。96孔板的边缘孔通常空置以避免假读数。

5.6 更换新的枪头,每孔加入100μl 2×染色混合液,上下吹打使充分混匀。

5.7 室温避光孵育15min。

5.8 荧光测定和数据分析

①以~485nm为激发波长,~530nm为发射波长(emission 1,绿色)来测定每孔荧光;

②以~485nm为激发波长,~630nm为发射波长(emission 2,红色)来测定每孔荧光;

③通过测定两种发射波长下的荧光强光,并计算荧光比值:RatioG/R=Fcell,em1/Fcell,em2

④以大肠杆菌悬液内活细胞的占比为横坐标,以RatioG/R为纵坐标,制图。

六、流式细胞仪操作步骤

仪器的检测配置可能要因实际情况来调整,但此处列出的检测技术和设置参数适用于市场上绝大多数流式细胞仪。

6.1 调整大肠杆菌悬液(活和杀死)使其密度为1×108个细菌/ml(~0.03 OD670),之后用无菌dH2O稀释100倍使其最终密度为1×106个细菌/ml。

6.2 参考表4在16×125mm高硼硅玻璃培养管内混11种不同比例的细菌悬液。每个样本的总体积为2ml。

表4. 流式细胞仪法检测活/死细菌所需不同比例活细菌和死细菌悬液的加量体积

活:死细菌比例 ml 活细菌悬液 ml 死细菌悬液
0:100 0 2.0
10:90 0.2 1.8
20:80 0.4 1.6
30:70 0.6 1.4
40:60 0.8 1.2
50:50 1.0 1.0
60:40 1.2 0.8
70:30 1.4 0.6
80:20 1.6 0.4
90:10 1.8 0.2
100:0 2.0 0

[温馨提示]:

参阅文章:Optimization of staining with SYTO 9/propidium iodide: interplay, kinetics and impact on Brevibacill,了解用SYTO 9/PI进行流式分析时参数设置的一些注意事项。

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名称 规格
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SYTO 9 (10,000× in DMSO)  LAMP用核酸染料是一款优秀的细胞核和染色体复染剂,具细胞膜渗透性

产品名称

产品编号 规格

SYTO 9 (10,000× in DMSO) LAMP用核酸染料

MF0763-100UL 100µl
SYTO 9 (10,000× in DMSO) LAMP用核酸染料 MF0763-500UL 500µl

SYTO 9 (10,000× in DMSO) LAMP用核酸染料 MF0763-1ML 1ml

产品描述

SYTO 9绿色荧光核酸染料(SYTO 9 Green Fluorescent Nucleic Acid Stain),是一款优秀的细胞核和染色体复染剂,具细胞膜渗透性。SYTO 9高亲和结合DNA(以及RNA),一旦结合后呈现明显增强的荧光信号,用蓝光激发(最大发射波长485nm),发绿色荧光(最大激发分别是498nm(DNA)和501nm(RNA))。SYTO 9由于能很好的渗透进入原核和真核细胞膜,普遍用作核复染剂(特别是细菌细胞),常常与死细胞核复染剂(比如:碘化丙啶PI)联合使用,用于活细菌/死细菌染色[1-2]。

更值得关注的是,SYTO 9作为一款灵敏的DNA结合染料,在RT-PCR中,表现出许多优异的特征,包括:在宽广的染料浓度下产生高度可重复的DNA熔解曲线,极低的PCR抑制率,高信噪比和高灵敏度,使其成为一款理想的SYBR Green I替代染料,用于RT-PCR、DNA熔解曲线分析、以及环介导等温扩增(LAMP)实验[3-5]。

本品为溶于DMSO的10000×SYTO 9核酸染料,适用于LAMP实验,亦可做PCR实验,使用时仅需根据实验体系加量使其终浓度在0.5×~2×之间优化即可。

保存与运输方法

保存:2-8℃避光保存,也可置于-20℃保存,2年有效。

运输:冰袋运输。

注意事项

1) 本品保存和使用过程中请注意避光。

2) 本品使用前,请置于室温回温,之后用漩涡混匀器完全混匀。本品高度稳定,但染料在保存的过程中会吸附到管壁上,漩涡混匀数秒使其充分溶解。

3) 目前没数据表明SYTO 9具致畸性或毒性。由于该探针与核酸结合,可能被当作一种潜在的突变剂,需做适当的防护措施。由于DMSO能促进有机分子进入组织,此储存液在使用的过程中务必妥善操作。根据当地的政策来处理使用本品后的废液。

4) 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

参考文献

[1] Stiefel P, Schmidt-Emrich S, Maniura-Weber K, Ren Q. Critical aspects of using bacterial cell viability assays with the fluorophores SYTO9 and propidium iodide. BMC Microbiol. 2015 Feb 18;15:36. doi: 10.1186/s12866-015-0376-x. PMID: 25881030; PMCID: PMC4337318.

[2] McGoverin C, Robertson J, Jonmohamadi Y, Swift S, Vanholsbeeck F. Species Dependence of SYTO 9 Staining of Bacteria. Front Microbiol. 2020 Sep 3;11:545419. doi: 10.3389/fmicb.2020.545419. PMID: 33013779; PMCID: PMC7494787.

[3] Quyen TL, Ngo TA, Bang DD, Madsen M, Wolff A. Classification of Multiple DNA Dyes Based on Inhibition Effects on Real-Time Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP): Prospect for Point of Care Setting. Front Microbiol. 2019 Oct 15;10:2234. doi: 10.3389/fmicb.2019.02234. PMID: 31681184; PMCID: PMC6803449.

[4] Monis PT, Giglio S, Saint CP. Comparison of SYTO9 and SYBR Green I for real-time polymerase chain reaction and investigation of the effect of dye concentration on amplification and DNA melting curve analysis. Anal Biochem. 2005 May 1;340(1):24-34. doi: 10.1016/j.ab.2005.01.046. PMID: 15802126.

[5] Oscorbin IP, Belousova EA, Zakabunin AI, Boyarskikh UA, Filipenko ML. Comparison of fluorescent intercalating dyes for quantitative loop-mediated isothermal amplification (qLAMP). Biotechniques. 2016 Jul 1;61(1):20-5. doi: 10.2144/000114432. PMID: 27401670.

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货号 名称 规格
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MF0763-100UL SYTO 9 (10,000× in DMSO) LAMP用核酸染料 100µl
MF0784-100UL PicoGreen dsDNA Reagent双链DNA检测试剂 100 µL
MF0785-100UL RiboGreen RNA Reagent RiboGreen RNA检测试剂 100 µL

 

SYTO 9 (10,000× in DMSO)  LAMP用核酸染料,SYTO 9绿色荧光核酸染料

SYTO 9绿色荧光核酸染料(SYTO 9 Green Fluorescent Nucleic Acid Stain),是一款优秀的细胞核和染色体复染剂,具细胞膜渗透性。SYTO 9高亲和结合DNA(以及RNA),一旦结合后呈现明显增强的荧光信号,用蓝光激发(最大发射波长485nm),发绿色荧光(最大激发分别是498nm(DNA)和501nm(RNA))。SYTO 9由于能很好的渗透进入原核和真核细胞膜,普遍用作核复染剂(特别是细菌细胞),常常与死细胞核复染剂(比如:碘化丙啶PI)联合使用,用于活细菌/死细菌染色[1-2]。

更值得关注的是,SYTO 9作为一款灵敏的DNA结合染料,在RT-PCR中,表现出许多优异的特征,包括:在宽广的染料浓度下产生高度可重复的DNA熔解曲线,极低的PCR抑制率,高信噪比和高灵敏度,使其成为一款理想的SYBR Green I替代染料,用于RT-PCR、DNA熔解曲线分析、以及环介导等温扩增(LAMP)实验[3-5]。

本品为溶于DMSO的10000×SYTO 9核酸染料,适用于LAMP实验,亦可做PCR实验,使用时仅需根据实验体系加量使其终浓度在0.5×~2×之间优化即可。

保存与运输方法

保存:2-8℃避光保存,也可置于-20℃保存,2年有效。

运输:冰袋运输。

注意事项

1) 本品保存和使用过程中请注意避光。

2) 本品使用前,请置于室温回温,之后用漩涡混匀器完全混匀。本品高度稳定,但染料在保存的过程中会吸附到管壁上,漩涡混匀数秒使其充分溶解。

3) 目前没数据表明SYTO 9具致畸性或毒性。由于该探针与核酸结合,可能被当作一种潜在的突变剂,需做适当的防护措施。由于DMSO能促进有机分子进入组织,此储存液在使用的过程中务必妥善操作。根据当地的政策来处理使用本品后的废液。

4) 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

参考文献

[1] Stiefel P, Schmidt-Emrich S, Maniura-Weber K, Ren Q. Critical aspects of using bacterial cell viability assays with the fluorophores SYTO9 and propidium iodide. BMC Microbiol. 2015 Feb 18;15:36. doi: 10.1186/s12866-015-0376-x. PMID: 25881030; PMCID: PMC4337318.

[2] McGoverin C, Robertson J, Jonmohamadi Y, Swift S, Vanholsbeeck F. Species Dependence of SYTO 9 Staining of Bacteria. Front Microbiol. 2020 Sep 3;11:545419. doi: 10.3389/fmicb.2020.545419. PMID: 33013779; PMCID: PMC7494787.

[3] Quyen TL, Ngo TA, Bang DD, Madsen M, Wolff A. Classification of Multiple DNA Dyes Based on Inhibition Effects on Real-Time Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP): Prospect for Point of Care Setting. Front Microbiol. 2019 Oct 15;10:2234. doi: 10.3389/fmicb.2019.02234. PMID: 31681184; PMCID: PMC6803449.

[4] Monis PT, Giglio S, Saint CP. Comparison of SYTO9 and SYBR Green I for real-time polymerase chain reaction and investigation of the effect of dye concentration on amplification and DNA melting curve analysis. Anal Biochem. 2005 May 1;340(1):24-34. doi: 10.1016/j.ab.2005.01.046. PMID: 15802126.

[5] Oscorbin IP, Belousova EA, Zakabunin AI, Boyarskikh UA, Filipenko ML. Comparison of fluorescent intercalating dyes for quantitative loop-mediated isothermal amplification (qLAMP). Biotechniques. 2016 Jul 1;61(1):20-5. doi: 10.2144/000114432. PMID: 27401670.

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更值得关注的是,SYTO 9作为一款灵敏的DNA结合染料,在RT-PCR中,表现出许多优异的特征,包括:在宽广的染料浓度下产生高度可重复的DNA熔解曲线,极低的PCR抑制率,高信噪比和高灵敏度,使其成为一款理想的SYBR Green I替代染料,用于RT-PCR、DNA熔解曲线分析、以及环介导等温扩增(LAMP)实验[3-5]。

本品为溶于DMSO的10000×SYTO 9核酸染料,适用于LAMP实验,亦可做PCR实验,使用时仅需根据实验体系加量使其终浓度在0.5×~2×之间优化即可。

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1) 本品保存和使用过程中请注意避光。

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4) 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

参考文献

[1] Stiefel P, Schmidt-Emrich S, Maniura-Weber K, Ren Q. Critical aspects of using bacterial cell viability assays with the fluorophores SYTO9 and propidium iodide. BMC Microbiol. 2015 Feb 18;15:36. doi: 10.1186/s12866-015-0376-x. PMID: 25881030; PMCID: PMC4337318.

[2] McGoverin C, Robertson J, Jonmohamadi Y, Swift S, Vanholsbeeck F. Species Dependence of SYTO 9 Staining of Bacteria. Front Microbiol. 2020 Sep 3;11:545419. doi: 10.3389/fmicb.2020.545419. PMID: 33013779; PMCID: PMC7494787.

[3] Quyen TL, Ngo TA, Bang DD, Madsen M, Wolff A. Classification of Multiple DNA Dyes Based on Inhibition Effects on Real-Time Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP): Prospect for Point of Care Setting. Front Microbiol. 2019 Oct 15;10:2234. doi: 10.3389/fmicb.2019.02234. PMID: 31681184; PMCID: PMC6803449.

[4] Monis PT, Giglio S, Saint CP. Comparison of SYTO9 and SYBR Green I for real-time polymerase chain reaction and investigation of the effect of dye concentration on amplification and DNA melting curve analysis. Anal Biochem. 2005 May 1;340(1):24-34. doi: 10.1016/j.ab.2005.01.046. PMID: 15802126.

[5] Oscorbin IP, Belousova EA, Zakabunin AI, Boyarskikh UA, Filipenko ML. Comparison of fluorescent intercalating dyes for quantitative loop-mediated isothermal amplification (qLAMP). Biotechniques. 2016 Jul 1;61(1):20-5. doi: 10.2144/000114432. PMID: 27401670.

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