Picogreen dsDNA Reagent;双链DNA检测试剂;RiboGreen;RNA定量试剂;ssDNA定量试剂;药物残留DNA检测;
Picogreen是一种极为灵敏的荧光核酸染料,常用于双链DNA的定量检测。历来DNA浓度的测定在cDNA文库的构建,DNA亚克隆、PCR产物的估测等领域中具有重要意义,疫苗等生物制品中残留微量DNA的检测更是直接关系到人类的健康。
Picogreen dsDNA定量检测:Picogreen仅在与DNA双链结合后才发出荧光,且所产生的荧光与DNA浓度呈正比,在存在ssDNA、RNA和单体核苷酸的条件下,可以选择性地检测低至25pg/ml的dsDNA。该分析在三个数量级范围内呈线性,且几乎无序列依赖性,可以精确地测量多个来源的DNA,包括基因组DNA、病毒DNA、小量提取DNA或PCR扩增产物。
相比传统的方法,Picogreen dsDNA Quantitation Reagent定量具有以下优势:①灵敏度高:数量级较UV吸光读数更敏感,可节省宝贵的样品;②特异性强:在等摩尔的RNA存在的条件下,对dsDNA具有特异性;③耐受性好:耐受较高浓度的盐、尿素、乙醇、氯仿、去垢剂、蛋白或琼脂糖,可以直接定量PCR扩增产物而无需从反应混合物中纯化DNA。④易于使用——只需在样品中加入染料,等待5分钟,然后读数即可,且适用于96和384孔板;与大多数基于荧光的酶标仪和荧光计兼容。⑤适用范围广:可适用于PCR的分析、芯片样品、DNA损伤分析、酶活性分析、基因组DNA定量以及复杂混合物中dsDNA的检测和病毒DNA定量等多种领域。
本试剂盒含有实验所需的所有试剂,使用更快捷方便。若按照2ml反应体系来计算(比色皿),10×100 µL kit可做100次反应;若按照200µl反应体系来计算(96孔板),10×100 µL kit可做1000次反应;单次反应体系取决于荧光检测仪器。
产品组分
编号 | 组分名称 | 产品编号(规格) | |
MF0781-0.5ML | MF0781-1ML | ||
A | Picogreen dsDNA reagent (200× in DMSO) | 100µl×5 | 100µl×10 |
B | Lambda DNA standard (10µg/ml) | 1ml | 1ml×2 |
C | 1×TE Buffer | 100ml | 100ml×2 |
A置于2-8℃干燥避光保存,亦可置于≤-20℃长期保存;
B置于2-8℃,亦可置于≤-20℃长期保存; C置于2-8℃保存,长期不用亦可置于-20℃保存; |
保存与运输方法
保存:2-8℃避光保存,1年有效。
运输:冰袋运输。
注意事项
- Picogreen含DMSO(已知有毒试剂),操作时请注意防护。
- 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
使用方法
一、PicoGreen (2×)工作液配制
使用前将PicoGreen dsDNA reagent回温至室温;PicoGreen是以100µL 200×的浓缩液形式保存于无水DMSO
中。实验当天,根据实验需求用1×TE按1:100 的比例稀释适量母液到PicoGreen (2×)。
例如:要准备足够的操作溶液以2ml检测体系测定20个样品,可向19.8mL1×TE 中加入200μL PicoGreen dsDNA reagent (200×)。
【注意】:a)由于试剂容易吸附到玻璃表面,要在塑料容器中配制。b)PicoGreen见光易降解,所以应将配好的溶液用铝箔包住或放置暗处避光保存。c)溶液最好在配制好数小时内使用,以保证最佳结果。d)Picogreen的最终工作浓度建议为1×;用户也可根据实际情况调整此浓度,比如:最终工作浓度调低到0.5×。
二、 检测步骤
2.1 Lambda DNA standard (200ng/ml)的配制
用1×TE对Lambda DNA standard (10µg/ml)进行50倍稀释。比如,向10µl Lambda DNA standard (10µg/ml)加入490µl 1×TE混匀,此时标准品浓度为200ng/ml;
2.2 标准曲线的制备
【注意】:根据2010年《中国药典》所提,PicoGreen定量DNA的方法检出限~0.3ng/ml。DNA含量在1.25-80ng/ml范围内线性较好(R2>0.99),因此,在此范围内设置浓度梯度,建议标准曲线较好。
①比色皿体系检测(2ml)
a、按照表1 向一次性微量比色皿中加入TE和Lambda DNA standard(200ng/ml),通过梯度稀释获得相应浓度的标准溶液,随后加入1ml PicoGreen (2×)定量试剂,混匀后,于室温避光孵育2-5min,并以1×TE缓冲液为blank。【注意】:确信不要在样品中引入气泡,轻轻地弹微量检测皿的外部,可以驱散气泡。
表1 比色皿体系所需加入各组分量及标准品终浓度表 | |||
TE (µl) | Lambda DNA standard (µl) | PicoGreen (2×) (µl) | Lambda DNA standard终浓度 |
0 | 1000(200ng/ml) | 1000 | 100ng/ml |
200 | 800(200ng/ml) | 1000 | 80ng/ml |
400 | 600(200ng/ml) | 1000 | 60ng/ml |
600 | 400(200ng/ml) | 1000 | 40ng/ml |
800 | 200(200ng/ml) | 1000 | 20ng/ml |
900 | 100(200ng/ml) | 1000 | 10ng/ml |
950 | 50(200ng/ml) | 1000 | 5ng/ml |
1000 | 0(200ng/ml) | 1000 | 0ng/ml (blank) |
b、于荧光仪中检测各浓度荧光值,Ex/Em=~480nm/520nm。
【注意】:为了确保荧光读数在荧光仪的检测范围内,应调节增益使含最高DNA浓度的样品荧光值接
近荧光仪的最大值;为了减少光漂白,应保持所有样品的检测时间一致。
c、各浓度标准溶液得到的荧光值减去空白对照荧光值,之后对DNA浓度和荧光值做标准曲线。
d、测量待检样本的荧光值。根据荧光值和所建立的标准曲线,来确定样本DNA的浓度。
- 微孔板体系检测(200µl)
a、 按照表2 向96孔板中加入TE和Lambda DNA standard(200ng/ml),通过梯度稀释获得相应浓度的标准溶液,随后加入100µl PicoGreen (2×)定量试剂,混匀后,于室温避光孵育2-5min,并以1×TE缓冲液为blank。【注意】:确信不要在样品中引入气泡,轻轻地弹微孔板的外部,可以驱散气泡。
表2酶标板体系所需加入各组分量及标准品终浓度表 | |||
TE (µl) | Lambda DNA standard (µl) | PicoGreen (2×) (µl) | Lambda DNA standard终浓度 |
0 | 100(200ng/ml) | 100 | 100ng/ml |
20 | 80(200ng/ml) | 100 | 80ng/ml |
40 | 60(200ng/ml) | 100 | 60ng/ml |
60 | 40(200ng/ml) | 100 | 40ng/ml |
80 | 20(200ng/ml) | 100 | 20ng/ml |
90 | 10(200ng/ml) | 100 | 10ng/ml |
95 | 5(200ng/ml) | 100 | 5ng/ml |
100 | 0(200ng/ml) | 100 | 0ng/ml (blank) |
b、于荧光酶标仪中检测各浓度荧光值,Ex/Em=~480nm/520nm。
【注意】:为了确保荧光读数在荧光仪的检测范围内,应调节增益使含最高DNA浓度的样品荧光值接
近荧光仪的最大值;为了减少光漂白,应保持所有样品的检测时间一致。
c、各浓度得到的荧光值减去空白对照荧光值,之后对DNA浓度和荧光值做标准曲线。
d、测量待检样本的荧光值。根据荧光值和所建立的标准曲线,来确定样本DNA的浓度。
应用示例(荧光定量):
附表 PicoGreen定量耐受的污染物列表
物质名称 | 最大耐受浓度 | 信号变化百分比 |
Salts | ||
Ammonium acetate | 50 mM | 3% decrease |
Sodium acetate | 30 mM | 3% increase |
Sodium chloride | 200 mM | 30% decrease |
Zinc chloride | 5 mM | 8% decrease |
Magnesium chloride | 50 mM | 33% decrease |
Urea | 2 M | 9% increase |
Organic Solvents | ||
Phenol | 0.1% | 13% increase |
Ethanol | 10% | 12% increase |
Chloroform | 2% | 14% increase |
Detergents | ||
Sodium dodecyl sulfate | 0.01% | 1% decrease |
Triton X-100 | 0.1% | 7% increase |
Proteins | ||
Bovine serum albumin | 2% | 16% decrease |
IgG | 0.1% | 19% increase |
Other Compounds | ||
Polyethylene glycol | 2% | 8% increase |
Agarose | 0.1% | 4% increase |