抗体/试剂/诊断抗体原料,SARS冠状病毒2核衣壳蛋白单克隆抗体(新冠抗原检测原料,可识别奥密克戎)

品牌:Bioss/博奥森 | 货号:bsm-41511R-100ug

产品编号 bsm-41511R
英文名称 SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Nucleocapsid, WT & Ormicron Recognized
中文名称 SARS冠状病毒2核衣壳蛋白单克隆抗体(新冠抗原检测原料,可识别奥密克戎)
别    名 SARS-CoV-2 Nucleocapsid Protein; SARS-CoV-2 NP; nucleocapsid protein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]; novel coronavirus N Protein; novel coronavirus Nucleocapsid Protein; 2019-nCoV Nucleoprotein; 2019-nCoV N; 2019nCoV N; 2019-nCoV N Protein; 2019 ncov N Protein; 2019-nCoV nucleocapsid protein; Ormicron mutant; Ormicron Nucleocapsid Protein; Ormicron N Protein.  
研究领域 细菌及病毒  
抗体来源 Rabbit
克隆类型 Monoclonal
克 隆 号 7B2
产品应用 WB=1:500-2000 ELISA=1:5000-10000 
not yet tested in other applications.
optimal dilutions/concentrations should be determined by the end user.
理论分子量 46kDa
性    状 Liquid
浓    度 >1mg/ml
免 疫 原 Recombinant SARS-CoV-2 Nucleocapsid Protein 
亚    型 IgG
纯化方法 Affinity purified by Protein A
缓 冲 液 0.01M PBS(pH7.4)
保存条件 Shipped at 4℃. Store at -20 °C for one year. Avoid repeated freeze/thaw cycles.
注意事项 This product as supplied is intended for research use only, not for use in human, therapeutic or diagnostic applications.
PubMed PubMed
产品介绍 Coronaviruses are enveloped viruses with a positive-sense RNA genome and with a nucleocapsid of helical symmetry. Coronavirus nucleoproteins localize to the cytoplasm and the nucleolus, a subnuclear structure, in both virus-infected primary cells and in cells transfected with plasmids that express N protein. Coronavirus N protein is required for coronavirus RNA synthesis, and has RNA chaperone activity that may be involved in template switch. Nucleocapsid protein is a most abundant protein of coronavirus. During virion assembly, N protein binds to viral RNA and leads to formation of the helical nucleocapsid. Nucleocapsid protein is a highly immunogenic phosphoprotein also implicated in viral genome replication and in modulating cell signaling pathways. Because of the conservation of N protein sequence and its strong immunogenicity, the N protein of coronavirus is chosen as a diagnostic tool.

SWISS:
P0DTC9

Gene ID:
43740575

产品图片
Sample:
Lane 1: Recombinant SARS-CoV-2 N Protein(Omicron(B.1.1.529) (P13L,E31del,R32del, S33del,R203K,G204R) at 100ng
Lane 2: Recombinant SARS-CoV-2 N Protein(Omicron(B.1.1.529) (P13L,E31del,R32del, S33del,R203K,G204R) at 50ng
Lane 3: Recombinant SARS-CoV-2 N Protein(Omicron(B.1.1.529) (P13L,E31del,R32del, S33del,R203K,G204R) at 25ng
Lane 4: Recombinant SARS-CoV-2 N Protein(Omicron(B.1.1.529) (P13L,E31del,R32del, S33del,R203K,G204R) at 10ng
Lane 5: Recombinant SARS-CoV-2 N Protein(Omicron(B.1.1.529) (P13L,E31del,R32del, S33del,R203K,G204R) at 5ng
Lane 6: Recombinant SARS-CoV-2 N Protein(WT) at 10ng
Primary: Rabbit Anti- SARS-CoV-2 N protein (bsm-41511R) at 1/1000 dilution
Secondary: IRDye800CW Goat Anti-Rabbit IgG at 1/20000 dilution
Predicted band size:45.3 kD
Observed band size:50 kD

Sample:
Lane 1:SARS-CoV-2 N Protein (WT) at 10ng
Lane 2:SARS-CoV-2 N Protein (Del204 & Del215) at 2ng
Lane 3:SARS-CoV-2 N Protein (R203M & D377Y) at 2ng
Primary: Rabbit Anti- SARS-CoV-2 N Protein Antibody at 1/1000 dilution
Secondary: IRDye800CW Goat Anti-Rabbit IgG at 1/20000 dilution
Predicted band size:46kD
Observed band size:46kD

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抗 SARS-CoV-2 S-RBD IgG ELISA 试剂盒 Wako 可检测与抗SARS-CoV-2的中和活性高度相关的IgG抗体

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抗 SARS-CoV-2 S-RBD IgG ELISA 试剂盒 Wako
可检测与抗SARS-CoV-2的中和活性高度相关的IgG抗体

  • 产品特性
  • 相关资料
  • Q&A
  • 参考文献

可检测与抗SARS-CoV-2的中和活性高度相关的IgG抗体抗 SARS-CoV-2 S-RBD IgG ELISA 试剂盒 Wako                              可检测与抗SARS-CoV-2的中和活性高度相关的IgG抗体

抗 SARS-CoV-2 S-RBD IgG ELISA 试剂盒 Wako

抗 SARS-CoV-2 S-RBD IgG ELISA 试剂盒 Wako                              可检测与抗SARS-CoV-2的中和活性高度相关的IgG抗体

本产品为定量SARS-CoV-2刺突蛋白受体结合域(S-RBD:S-protein Receptor-binding domain)IgG抗体量的ELISA试剂盒。据报告显示,使用本产品测定的IgG抗体量与样品中抗SARS-CoV-2的中和活性之间具有高度相关性1)

病毒中和测试不仅费时费力,还需要生物安全等级3(BSL3)的设施。使用本产品,无需处理SARS-CoV-2,即可检测与样品中的中和活性显示高度相关的抗SARS-CoV-2 S-RBD的IgG抗体量。

抗 SARS-CoV-2 S-RBD IgG ELISA 试剂盒 Wako                              可检测与抗SARS-CoV-2的中和活性高度相关的IgG抗体

使用与本产品相同的ELISA系统,检测SARS-CoV-2患者血液中15种抗S蛋白和N蛋白的抗体,作为过去的感染指标,抗S蛋白抗体的表现优异。另外,进行中和活性测试以研究与中和活性的相关性,结果表明在15种抗体中抗S-RBD的IgG抗体与中和活性相关性最高1)


试剂盒组成

包含反应必需的全部试剂(共11种)。

● SARS-CoV-2 S蛋白固相化孔板 

96 well×1 plate

● 过氧化物酶(POD)标记的抗体溶液

6 mL×1瓶

● 浓缩清洗液(10×)

100 mL×1瓶

● 显色液(TMB溶液)

11 mL×1瓶

● 反应终止液(1N HCL)

11 mL×1瓶

● 样品稀释液(0U/mL) 

100 mL×2瓶

● 抗SARS-CoV-2 IgG标准品-1(62.5U/mL)

500 μL×1瓶

● 抗SARS-CoV-2 IgG标准品-2(125U/mL)

500 μL×1瓶

● 抗SARS-CoV-2 IgG标准品-3(187.5U/mL)

500 μL×1瓶

● 抗SARS-CoV-2 IgG标准品-4(250U/mL)

500 μL×1瓶

● 封板膜

3张

◆检测原理


抗 SARS-CoV-2 S-RBD IgG ELISA 试剂盒 Wako                              可检测与抗SARS-CoV-2的中和活性高度相关的IgG抗体

1. 向SARS-CoV-2 S-RBD重组抗原固相化孔板中添加样品后开始反应

2. 样品中的抗SARS-CoV-2 IgG与孔板上的抗原结合

3. 与POD标记抗人IgG单抗(小鼠)反应

4. 抗原-抗-SARS-CoV-2 IgG-POD-标记抗体的复合物形成

5. 使用吸光度检测设备测定孔中的POD活性(450 nm/620 nm)

※ 孔内的POD活性与抗SARS-CoV-2 IgG量成比例。

◆试剂盒性能

  标准曲线检测范围

  2-250 U/mL(本公司内部单位)

  检测对象

  抗SARS-CoV-2   S 蛋白RBD区域的IgG抗体

  检测目标样品

  人血清、血浆

  所需样品量

  5 μL

  检测时间

  3 h

  检测方法

  显色法

标准曲线示例


抗 SARS-CoV-2 S-RBD IgG ELISA 试剂盒 Wako                              可检测与抗SARS-CoV-2的中和活性高度相关的IgG抗体


【参考文献】


1) Fujigaki, H. et al. : J. Immunol., 206(10), 2393(2021).

※ 本页面产品仅供研究用,研究以外不可使用。


产品列表

产品编号 产品名称 产品规格 产品等级 备注
290-84201 Anti SARS-CoV-2 S-RBD IgG ELISA Kit Wako 96 tests 用 免疫化学用

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SARS-COV-2中和抗体检测试剂盒 AdipoGen再推出新冠研究中和抗体试剂盒,逐一识破SARS-CoV-2突变体!

AdipoGen再推出新冠研究中和抗体试剂盒,逐一识破SARS-CoV-2突变体!

SARS-COV-2中和抗体检测试剂盒

2020年至今,新型冠状病毒COVID-19在全球肆虐,在世界范围内造成严重的公共健康危机和无可估量的经济损失。AdipoGen所推出的SARS-CoV-2 Neutralizing Antibodies Detection Kit系列经过严密的科研验证,精确度高,是用于定性SARS-CoV-2中和抗体的有效工具1

随着疫症的大规模流行,多种SARS-CoV-2冠状病毒的突变毒株陆续在世界各地被发现,其中Omicron亚型BA.2是至今传染性和免疫逃逸能力最强的突变体。为更好地研究这些突变毒株,AdipoGen研发了针对多种突变体的SARS-CoV-2中和抗体ELISA检测试剂盒。以下这些试剂盒含有检出人体血浆或血清中针对 SARS-CoV-2 突变体的功能性中和抗体所必要的关键试剂,基于比色法,能简单快捷地替代使用 Vero E6 细胞进行的经典的中和试验法。

 

B.1.1.7 突变体(英国突变)

SARS-COV-2中和抗体检测试剂盒 AdipoGen再推出新冠研究中和抗体试剂盒,逐一识破SARS-CoV-2突变体!

 

B.1.1.7 (也称作20I/501Y.V1、 VOC 202012/01)突变体在英国首次被发现,并于2020年12月开始在美国大范围传播,逐渐成为最常见的病毒2。突变产生于棘突蛋白的受体结合域(receptor binding domain,缩写RBD) 的 501 位(N501Y),并且相比以往的突变体,B.1.1.7的传播性高出40~70%。

名称

 SARS-CoV-2 Neutralizing Antibodies Detection Kit (B.1.1.7 Variant, UK)

规格

 1 kit (96 tests)

应用

 定性ELISA(比色法)

物种交叉性

 鸟类、牛、山羊、豚鼠、人、猴、小鼠、猪、兔、大鼠

样品类型

 血浆、血清

 

 

P.1 突变体(巴西突变)

 

P.1 (也称作20J/501Y.V3)突变体在巴西首次检测出,于棘突蛋白RBD 的417、 484 和 501 (K417T、E484K、N501Y)携带三个突变7。P.1或巴西突变体是 SARS-CoV-2 冠状病毒的一种形式,可能是导致巴西北部城市Manaus的病例激增的原因。研究指出,P.1 的传染性或高出以往的SARS-CoV-2病毒株1.7~2.4倍,并且患过COVID-19的人群依然有可能被P.1突变体再度感染3

名称

 SARS-CoV-2 Neutralizing Antibodies Detection Kit (P.1 Variant, BR)

规格

 1 kit (96 tests)

应用

 定性ELISA(比色法)

物种交叉性

 鸟类、牛、山羊、豚鼠、人、猴、小鼠、猪、兔、大鼠

样品类型

 血浆、血清

B.1.351 突变体(南非突变)

在南非发现的 SARS-CoV-2 的突变体称为 B.1.351(别名20H/501Y.V2)。该突变体在棘突蛋白RBD 的第 417、484 和 501 位(K417N、E484K、N501Y)携带三个突变4,并且B.1.351与更高的病毒载量相关,这可能意味着传染性有上升的趋势。

名称

 SARS-CoV-2 Neutralizing Antibodies Detection Kit (B.1.351 Variant, SA)

规格

 1 kit (96 tests)

应用

 定性ELISA(比色法)

物种交叉性

 鸟类、牛、山羊、豚鼠、人、猴、小鼠、猪、兔、大鼠

样品类型

 血浆、血清

◆B.1.617.2 突变体(Delta突变)

B.1.617.2 Delta突变体为首次在印度发现的B.1.617谱系之下,携带L452R棘突受体结合基序 (RBM) 替代。与携带 D614G 的野生型Wuhan- 1相比,B.1.617.2 Delta在体外对来自痊愈个体的血清中和抗体的敏感性降低了六倍,对疫苗引发的抗体的敏感性降低了八倍。还观察到 B.1.617.2 Delta 比 B.1.617.1 具有更强的复制能力和棘突介导的侵入,这可能解释了 B.1.617.2 Delta的为什么比B.1.617及其他亚系更广泛传播。5

 

名称

 SARS-CoV-2   Neutralizing Antibodies Detection Kit (B.1.617.2 Variant, Delta)

规格

 1 kit (96 tests)

应用

 定性ELISA(比色法)

物种交叉性

 鸟类、牛、山羊、豚鼠、人、猴、小鼠、猪、兔、大鼠

样品类型

 血浆、血清

 

 

◆SARS-CoV-2的B.1.1.529 突变体(Omicron突变体)

 

2021年11月9日,南非首次从病例样本中检测到一种新冠病毒B.1.1.529变异株。在很多时间内该变异株即成为当地绝对优势变异株,并迅猛蔓延到全球。2021年11月26日,WHO将其定义为第五种“关切变异株”(variant of concern, VOC),取名希腊字母Omicron(奥密克戎)变异株。

AdipoGen提供Omicron突变刺突蛋白 S1 (aa 319-541) 的受体结合结构域 (RBD),包含突变 G339D、S371L、S373P、S375F、K417N、N440K、G446S、S477N、T478K、E484A、Q493K、G496S、Q498R , N501Y & Y505H突变,并 融合到人 IgG1 Fc 区的 N 端。

 

产品编号

产品名称

包装

AG-40B-0220-C050

SARS-CoV-2 Spike Protein S1 (RBD):Fc (human) (rec.) (B.1.1.529   Variant, Omicron)

50   µg

AG-40B-0220-3050

3×50 µg

◆产品列表

 

产品编号

产品名称

包装

AG-48B-0003-KI01

SARS-CoV-2 Neutralizing Antibodies Detection Kit (B.1.1.7 Variant, Alpha)

曾用名:SARS-CoV-2 Neutralizing Antibodies Detection Kit(B.1.1.7 Variant, UK)

96 wells

AG-48B-0004-KI01

SARS-CoV-2 Neutralizing Antibodies Detection Kit (P.1 Variant, Gamma)

曾用名:SARS-CoV-2 Neutralizing Antibodies Detection Kit(P.1 Variant, BR)

AG-48B-0005-KI01

SARS-CoV-2 Neutralizing Antibodies Detection Kit (B.1.351 Variant, Beta)

曾用名:SARS-CoV-2 Neutralizing Antibodies Detection Kit(B.1.351 Variant, SA)

AG-48B-0007-KI01

SARS-CoV-2 Neutralizing Antibodies Detection Kit (B.1.617.2 Variant, Delta)

 

相关产品

 

2019-nCoV 棘突蛋白 S1 (RBD) 中和抗体试剂盒(非突变体)

产品编号

产品名称

包装

AG-48B-0002-KI01

SARS-CoV-2 Neutralizing Antibodies Detection Kit

96 wells

 

 

各种突变体的SARS-CoV-2重组棘突蛋白

 

产品编号

产品名称

包装

AG-40B-0202-3050

SARS-CoV-2 Spike Protein S1 (RBD):Fc (human) (rec.) (B.1.1.7 Variant, Alpha)

曾用名:SARS-CoV-2 Spike Protein S1 (RBD):Fc (human)(rec.)(B.1.1.7 Variant, UK)

3 x 50 µg

AG-40B-0202-C050

50 µg

AG-40B-0205-C050

SARS-CoV-2 Spike Protein S1 (RBD) (rec.) (His) (B.1.1.7 Variant, Alpha)

50 µg

AG-40B-0205-3050

3 x 50 µg

AG-40B-0204-3050

SARS-CoV-2 Spike Protein S1 (RBD):Fc (human) (rec.) (P.1 Variant, Gamma)

曾用名:SARS-CoV-2 Spike Protein S1 (RBD):Fc (human)(rec.)(P.1 Variant, BR)

3 x 50 µg

AG-40B-0204-C050

50 µg

AG-40B-0203-3050

SARS-CoV-2 Spike Protein S1 (RBD):Fc (human) (rec.) (B.1.351 Variant, Beta)

曾用名:SARS-CoV-2   Spike Protein S1 (RBD):Fc (human)(rec.)(B.1.351 Variant, SA)

3 x 50 µg

AG-40B-0203-C050

50 µg

AG-40B-0206-C050

SARS-CoV-2 Spike Protein S1 (RBD) (rec.) (His) (B.1.351 Variant, Beta)

50 µg

AG-40B-0206-3050

3 x 50 µg

AG-40B-0220-C050

SARS-CoV-2 Spike Protein S1 (RBD):Fc (human) (rec.) (B.1.1.529 Variant, Omicron)

50 µg

AG-40B-0220-3050

3 x 50 µg

※以上所有产品仅供实验研究用,不可用于人体,不可用作医药品、食品、临床诊断等。

 

◆参考文献

 

1.

Comparison of two commercial surrogate ELISAs to detect a neutralising antibody response to SARS-CoV-2.

 

2.

CDC says there’s no evidence of a ‘USA variant’ of the coronavirus, dismissing rumors stoked by the White House task force. 全文

 

3.

The P.1 coronavirus variant is twice as transmissible as earlier strains 

 

4.

Science Brief: Emerging SARS-CoV-2 Variants 全文

 

5.

SARS-CoV-2 B.1.617.2 Delta variant replication and immune evasion 全文

 

 


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SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

产品中心 > 生命科学 > 疾病研究 > 传染性疾病

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit
SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

  • 产品特性
  • 相关资料
  • Q&A
  • 参考文献

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit

SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

试剂盒组成

20 Reactions

RT酶混合物(20×)

20 µL x 1支

一步反应混合物(2×)

200 μL x 1支

484E Wild Type Primer & Probe   Mixture(probe:FAM)
484E野生型引物&探针混合物(探针:FAM)

10 µL x 1支

E484K Mutant Type Primer & Probe   Mixture(probe:FAM)
E484K突变型引物&探针混合物(探针:FAM)

10 µL x 1支

200 Reactions

RT酶混合物(20×)

200 µL x 1支

一步反应混合物(2×)

1 mL x 2支

484E Wild Type Primer & Probe   Mixture(probe:FAM)
484E野生型引物&探针混合物(探针:FAM)

100 µL x 1支

E484K Mutant Type Primer & Probe   Mixture(probe:FAM)
E484K突变型引物&探针混合物(探针:FAM)

100 µL x 1支

背景

新冠病毒突变株在世界范围内不断扩散,感染人数也在不断增多。

有报告指出,新冠病毒Beta(B.1.351)突变株和Gamma(P.1)突变株含有的E484K突变或会逃避免疫,使疫苗的效果降低1-3)


※ Beta(B.1.351)突变株:在南非首次发现的突变株

※ Gamma(P.1)突变株:在巴西首次发现的突变株

 

通过FUJIFILM Wako开发的Primer设计技术,可以高灵敏检测难以被检测的基因点突变。本产品是快速简便检测E484K突变的试剂盒。

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

特点

判定容易

通过比较使用突变株与野生株Primer/Probe Set时的Ct值来判定

一步法RT-qPCR快速检测突变

约70 min即可完成

使用FUJIFILM Wako研发的Primer/Probe,高灵敏检测突变

所有突变株均可在相同的反应条件下检测

由于N501Y、E484K、L452R、E484Q的PCR反应条件均相同,可在同一个96孔板中进行检测。

 

 

检测原理

采用TaqMan®探针的一步法RT-qPCR。

利用FUJIFILM Wako开发的Primer,高灵敏度检测点突变。

▼使用前

病毒RNA量较多情况下,在突变株中使用常规株(非突变)检测用“484E Wild type Primer & Probe Mixture”,也可以观察到扩增信号。务必使用常规株(非突变)检测用的“484E Wild type Primer & Probe Mixture”和突变株检测用的“E484K Mutant Type Primer & Probe Mixture”两种试剂进行检测。

比较两个Ct值,若突变株检测用“E484K Mutant Type Primer & Probe Mixture”的Ct值小,则可判断病毒为E484K突变株。

突变株的检测应用数据

本试剂盒已经检出以下3种新冠病毒(SARS-CoV-2)株。

● Gamma株(P.1)突变株(TY7-501、E484K突变N501Y突变,由日本国立感染症研究所提供)

● Beta株(B.1.351)突变株(TY8-612、E484K突变、N501Y突变,由日本国立感染症研究所提供)

● Alpha株(B.1.1.7)突变株(QHN001、E484K无突变N501Y突变,由日本国立感染症研究所提供)

● VR-1986HK(E484K无突变N501Y突变ATCC)

样品拷贝份数:5000、500、50 copies/Well

循环数:45

 


 gamma(P.1)株:TY7-501(E484K突变、N501Y突变)

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

5000 copies

500 copies

50 copies

Gamma株

(含有E484K突变)

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

对于含有E484K突变的gamma株(P.1)突变株,使用突变株检测用的“E484K Mutant type Primer & Probe”,可以确认到扩增信号

常规株(非突变)检测用的“484E Wild type Primer & Probe”,在5000 copies的条件下可以观察到扩增信号,但可以在更低Ct值下检测到突变株,由此判断为E484K突变株。在500 copies和50 copies的条件下,未能检测到常规(非突变)的扩增信号。



 Beta株(B.1.351):TY8-612(E484K突变、N501Y突变)

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

5000 copies

500 copies

50 copies

Beta株

(含有E494K突变)

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

对于含有E484K突变的beta株(B.1351)突变株,使用突变株检测用的“E484K Mutant type Primer/Probe”,可以确认到扩增信号

常规株(非突变)检测用的“484E Wild type Primer/Probe”,在5000 copies的条件下可观察到轻微的扩增信号,但可以在更低的Ct值下检测到突变株,由此判断为E484K突变株。在500 copies和50 copies的条件下,未能检测到常规(非突变)的扩增信号。



 Alpha株(B.1.1.7):QHN001(E484K无突变N501Y突变)

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

5000 copies

500 copies

50 copies

alpha株

(含有E484K突变)

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SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

对于不含E484K突变的alpha株(B.1.1.7)突变株,利用常规(非突变)检测用的“484E Wild type Primer&Probe”,可以确认到扩增信号

突变株检测用的“E484K Mutant type Primer&Probe”,在5000copies的条件下可观察到扩增信号,但可以在更低的Ct值下检测到常规(非突变),由此判断为常规株的突变株。在500 copies和50 copies的条件下,未能检测到突变株的扩增信号。

 


④ VR-1986HKE484K无突变N501Y无突变)

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5000 copies

500 copies

50 copies

无突变

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对于不含N501Y突变和E484K突变的VR-1986HK,利用常规(非突变)检测用的“484E Wild type Primer&Probe”,可以确认到扩增信号

关于突变株检测用的“E484K Mutant type Primer&Probe”,在5000 copies的条件下可观察到扩增信号,但可以在更低的Ct值下检测到常规(非突变),由此判断为常规株的突变株。在500 copies和50 copies的条件下,未能检测到突变株的扩增信号。

PCR反应条件

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

◆常规株以及突变株的基因型

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FAQ

Q:能否判定新冠病毒阳性/阴性?

A:本试剂盒检测阳性样品中是否存在基因突变,无法判定阳性/阴性。

Q:能否检测用直接PCR法简单提取的RNA样品?

A本试剂盒无法检测简单提取的RNA。请使用RNA提取/纯化试剂盒等生成的RNA。

      离心柱:ISOSPIN Viral RNA(产品编号: 310-08931, 日本基因)

      自动核酸提取仪:QuickGene-Auto 12S/24S(倉敷紡績,还需要QuickGene AutoS RNA Virus Kit)

Q:试剂盒包装“200 Reactions”是什么意思?

A:【200 Reactions】是指实时PCR可以分开200孔进行。1个样品需要2个孔,即100个样品。

 ①    含有常规株的Primer&Probe的孔

 ②    含有突变株的Primer&Probe的孔

Q:试剂盒中是否包含病毒的阳性对照RNA?

A:本试剂盒不含阳性对照。若有需要,请向FUJIFILM Wako客服咨询。

Q:当野生株和突变株的扩增曲线均起峰时,应如何判断?

A如果病毒量高,无论是突变株样品,还是野生株,都有可能在其Primer&Probe中观察到扩增信号。然而,在此情况下,突变株的扩增信号上升

      得更快(Ct值小)。请务必通过突变株和常规株用的两种Primer&Probe进行检测,以确定 Ct 值的差异。

Q:是否存在E484K单独突变?

A不含N501Y突变、但含E484K突变的E484K单独突变株,已被确认为R.1株。但目前的信息较少,日本国立传染病研究所认为它是需要关注的突

      株(VOI),而不是高关注突变株(VOC)。

参考文献

1.

Nelson, G., Buzko, O., Spilman, P., Niazi, K., Rabizadeh, S., Soon-Shiong, P. : bioRxiv (2021). doi:https://doi.org/10.1101/2021.01.13.426558

2.

 Jangra, S., Ye, C., Rathnasinghe, R., Stadlbauer, D., PVI study group, Krammer,F., Simon, V., Martinez-Sobrido, L., García-Sastre, A., Schotsaert, M. : medRxiv (2021). doi:https://doi.org/10.1101/2021.01.26.21250543

3.

Wang, Z. et al. : Nature (2021). doi:10.1038/s41586-021-03324-6


产品列表

产品编号 产品名称 产品规格 产品等级 备注
287-35603 SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit 
SARS-CoV-2 E484K突变检测试剂盒
20 Reactions
281-35601 SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit 
SARS-CoV-2 E484K突变检测试剂盒
200 Reactions

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SARS-CoV-2 N del31-33 突变检测试剂盒 SARS-CoV-2 N del31-33 Mutation Detection Kit

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SARS-CoV-2 N del31-33 突变检测试剂盒
SARS-CoV-2 N del31-33 Mutation Detection Kit

  • 产品特性
  • 相关资料
  • Q&A
  • 参考文献

SARS-CoV-2 N del31-33 Mutation Detection KitSARS-CoV-2 N del31-33 突变检测试剂盒                              SARS-CoV-2 N del31-33 Mutation Detection Kit

SARS-CoV-2 N del31-33 突变检测试剂盒


本产品是一步法RT-qPCR检测新型冠状病毒(SARS-CoV-2)Omicron毒株(B.1.1.529)中N区存在的特征性突变del31-33的试剂盒。del31-33 是指N区第31~33位中E、R 和 S三个氨基酸缺失的突变。Omicron毒株是在南非首次发现的变异株,在刺突蛋白中含有30多个突变。它比传统的变异株具有更高的传染性,因而被世界卫生组织(WHO)列为“关切变异株”(Variant of Concern;VOC)。

本产品针对的是突变位点少的N区突变,并非突变位点多的S区。因此引物探针不会与其他突变位点产生反应、干扰测试,即可特异性、高灵敏度检测Omicron。

经证实,本产品不与Alpha变异株、Beta变异株、Gamma变异株产生反应,只与Omicron毒株产生特异性反应。


SARS-CoV-2 N del31-33 突变检测试剂盒                              SARS-CoV-2 N del31-33 Mutation Detection Kit

SARS-CoV-2 N del31-33 突变检测试剂盒【281-37703

◆试剂盒组成

20 Reactions

  RT 酶混合物(20×)

20 μL×1

  一步反应混合物(2×)

200 μL×1

  野生型引物&探针混合物
(Wild Type Primer & Probe Mixture)

10 μL×1

  N del31-33突变型引物&探针混合物
(N del31-33 Mutant Type Primer & Probe Mixture)

10 μL×1

◆特点


● 容易判断

● 使用突变型和传统型的引物/探针套装时,可通过比较Ct值进行判断

● 一步法RT-qPCR法快速检测突变

● 约70 min 即可完成

● 使用独立研发的引物探针进行高灵敏突变检测

● 当与其他突变体检测试剂盒组合使用时,所有变异株均可于同一反应条件下在1块96孔板上进行检测

● N501Y、E484K、L452R、E484Q、del247-253、N del31-33试剂盒的所有PCR反应条件相同,因此可在

● 1块96孔板上进行检测

 

◆检测原理


采用TaqMan® 探针的1-step RT-qPCR。

  ▼使用前
  在病毒RNA量多的情况下,使用传统(非突变)型检测用的Wild Type Primer / Probe,也能在变异株中观察到扩增信号。请务必使用传统

  (非突变)型检测用的Wild Type Primer/Probe 和突变型检测用的Mutant Type  Primer/Probe两种进行检测。比较两种Ct值,若突变型

  测用Mutant Type  Primer/Probe的Ct值较小,则判断该病毒为变异株。

◆实验案例


变异株检测的应用数据


用以下5种新型冠状病毒株的纯化RNA对本试剂盒进行测试:

● Omicron毒株(B.1.1.529):TY38-873P1,由日本国立传染病研究所提供

● alpha毒株(B.1.1.7):QHN001,N501Y突变,由日本国立传染病研究所提供

● Beta毒株(B.1.351):TY8-612,N501Y突变,E484K突变,由日本国立传染病研究所提供

● gamma毒株(P.1):TY7-501,N501Y突变,E484K突变,由日本国立传染病研究所提供

● 传统毒株(VR-1986HK):从ATCC购买的热灭活新型冠状病毒株

样本拷贝数:5000拷贝/孔

循环数:45

 

① Omicron株(B.1.1.529):TY38-873P1


SARS-CoV-2 N del31-33 突变检测试剂盒                              SARS-CoV-2 N del31-33 Mutation Detection Kit

Omicron毒株在N区含有del31-33突变,因此N del31-33 Mutant type Primer / Prob的扩增曲线(红色)比Wild type Primer / Probe的扩增曲线(蓝色)更早起峰。

 

② alpha株(B.1.1.7):QHN001

SARS-CoV-2 N del31-33 突变检测试剂盒                              SARS-CoV-2 N del31-33 Mutation Detection Kit

alpha毒株在N区中不含del31-33突变,因此Wild type Primer / Probe(蓝色)的扩增曲线比 N del31-33 Mutant type Primer / Probe(红色)的扩增曲线更早起峰。虽然alpha毒株与Omicron毒株均含有N501Y突变,但经确认本产品不与alpha毒株产生反应。

 

③ Beta株(B.1.351):TY8-612

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Beta毒株在N区中不含有del31-33突变,因此Wild type Primer / Probe的扩增曲线(蓝色)比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的扩增曲线(红色)更早起峰。虽然Beta毒株与Omicron毒株均含有N501Y突变,但经确认本产品不与Beta毒株产生反应。

 

④ gamma毒株(P.1):TY7-501

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gamma毒株在N区中不含del31-33,因此Wild type Primer / Probe的扩增曲线(蓝色)比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的扩增曲线更早起峰。虽然gamma毒株与Omicron毒株均有N501Y突变,但经确认本产品不与gamma毒株产生反应。

 

⑤ 传统毒株(VR-1986HK):从ATCC购买的热灭活新型冠状病毒株

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传统毒株在N区中不含del31-33突变,因此Wild type Primer / Probe的扩增曲线(蓝色)比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的扩增曲线(红色)更早起峰。

 

对照RNA的检测数据


使用本试剂盒测定合成Omicron菌株的对照ssRNA。

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在不含N del31-33突变的对照ssRNA(Wild Type Control RNA)中,Wild type Primer / Probe的扩增曲线(蓝色)比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的扩增曲线(红色)更早起峰。

在含N del31-33突变的对照ssRNA(N del31-33 Mutant Type Control RNA)中,N del31-33 Mutant type Primer / Probe的扩增曲线(红色)比Wild type Primer / Probe的扩增曲线(蓝色)更早起峰。

PCR反应条件


将板置于qPCR仪板,按以下流程设定。

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◆变异株一览表

变异株

N501Y突变

E484K突变

L452R突变

E484Q突变

del247-253突变

N del31-33突变

传统毒株

Alpha毒株
(B.1.1.7)

Beta毒株
(B.1.351)

Gamma毒株
(P.1)

Epsilon毒株(B.1.427/B.1.429)

Kappa毒株(B.1.617.1)

Delta毒株 (B.1.617.2)

Lambda毒株 (C.37)

Omicron毒株(B.1.1.529)

※含E484A突变

※ 本页面产品仅供研究用,研究以外不可使用。


FAQ


Q1:是否可以判断新型冠状病毒阳性/阴性?

A1:本试剂盒用于检测阳性样品中是否存在基因突变,不能判断为阳性/阴性。请使用SARS-CoV-2 RT-qPCR Detection Kit Ver. 2(产品编号:285-33801)进行阳性/阴性的判断。本试剂盒也可以与 RNA简易提取试剂SARS-CoV-2 Lysis Buffer Ver. 2(产品编号:281-34501) 配合使用。

 


Q2:是否可以检测direct PCR 等简单提取的RNA样品?

A2:请使用RNA提取/纯化试剂盒纯化的RNA。

● 离心柱类型:ISOSPIN病毒RNA(产品编号:310-08931,Nippon Gene)

● 自动核酸提取仪:QuickGene-Auto 12S / 24S(仓敷纺织,另需QuickGene AutoS RNA Virus Kit,产品编号:633-50801)

 

 

Q3:试剂盒包装【20 Reactions】是指?

A3:【20 Reactions】指可以分开进行20孔的实时PCR。每个样品需要2个孔(如下),即10个样品。

①含有传统菌株Primer / probe的孔

②含有变异毒株Primer / probe的孔

 


Q4:试剂盒中是否包含病毒的阳性对照RNA?

A4:本试剂盒不含阳性对照。

 


Q5:当野生型和突变型的扩增曲线均起峰时,应如何进行判断?

A5:如果病毒量高,无论是变异株样品,还是野生株,都有可能在其引物/探针中观察到扩增信号。然而,在此情况下,变异株的扩增信号上升得更快(Ct值小)。请务必通过变异株和传统菌株用的两种引物和探针进行检测,以确定 Ct 值的差异。详情请参阅说明书中的“判断方法”。


产品列表

产品编号 产品名称 产品规格 产品等级 备注
281-37703 SARS-CoV-2 N del31-33 Mutation Detection Kit
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20 Reactions

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SARS-CoV-2 N501Y Mutation Detection Kit SARS-CoV-2 N501Y突变检测试剂盒

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SARS-CoV-2 N501Y Mutation Detection Kit
SARS-CoV-2 N501Y突变检测试剂盒

  • 产品特性
  • 相关资料
  • Q&A
  • 参考文献

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SARS-CoV-2 N501Y 突变检测试剂盒

试剂盒组成

供20次反应用

RT Enzyme Mix (20×)

RT 酶混合物(20x)

20 µL x 1支

One-Step Reaction Mix (2×)

一步反应混合物(2×)

200 μL x 2支

501N Wild type Primer/Probe (Probe:FAM)

501N 野生型引物&探针混合物(探针:FAM)

10 µL x 1支

N501Y Mutant Type   Primer/Probe (Probe:FAM)

N501Y 突变型引物&探针混合物(探针:FAM)

10 µL x 1支

供200次反应用

RT Enzyme Mix (20×)

RT 酶混合物(20x)

200 µL x 1支

One-Step Reaction Mix (2×)

一步反应混合物(2×)

1 mL x 2支

501N Wild type Primer/Probe (Probe:FAM)

501N 野生型引物&探针混合物(探针:FAM)

100 µL x 1支

N501Y Mutant Type   Primer/Probe (Probe:FAM)

N501Y 突变型引物&探针混合物(探针:FAM)

100 µL x 1支

背景


新冠病毒突变株在世界范围内不断扩散,感染人数也在不断增多。如Alpha (B.1.1.7)、Beta (B.1.351) 和 Gamma (P.1) 突变株都有着N501位点的突变,与常规毒株相比,具有更强的感染性。

※ Alpha (B.1.1.7):英国最先检测出的突变株

       Beta (B.1.351):南非最先检测出的突变株

       Gamma (P.1):巴西最先检测出的突变株

通过FUJIFILM Wako研发的Primer技术,可以高灵敏度检测难以检测的基因点突变。本试剂盒可以快速、简便地检测N501Y突变。

SARS-CoV-2 N501Y Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 N501Y突变检测试剂盒

特点

      判定容易

    使用突变株与常规株(无突变)的Primer/Probe (引物/探针)套装,通过比较Ct值进行判定

      使用一步法RT-qPCR,快速检测突变

    约70 min即可完成

      使用FUJIFILM Wako研发的Primer/Probe(引物/探针)套装,高灵敏度检测突变

      所有突变株可在相同反应条件下进行检测

     由于N501Y、E484K、L452R、E484Q的PCR反应条件相同,因此可在同一块96孔板中进行检测。

 


检测原理

采用TaqMan® 探针的One Step RT-qPCR法进行检测。

利用FUJIFILM Wako开发的Primer引物技术,高灵敏度检测点突变。

▼使用前

病毒RNA量较多时,在突变株中使用常规株(非突变)检测用的“501N Wild type Primer/Probe”,也可以观察到扩增信号。

务必使用常规株(非突变)检测用的“501N Wild type Primer/Probe”和突变株检测用的“N501Y Mutant Type Primer/Probe”两种试剂进行检测。

比较两种试剂的Ct值,若突变株检测用“N501Y Mutant Type Primer/Probe”的Ct值小,则可判断病毒为N501Y突变株。

突变株的检测应用数据

本试剂盒已检测出以下4种新冠病毒(SARS-CoV-2)株。

● Alpha (B.1.1.7)突变株(QHN001、N501Y突变,由国立感染症研究所提供)

● Beta (B.1.351)突变株(TY8-612、N501Y突变、E484K突变,由国立感染症研究所提供)

● Gamma (P.1)突变株(TY7-501、N501Y突变、E484K突变,由国立感染症研究所提供)

● VR-1986HK(N501Y无突变、E484K无突变 ATCC)

拷贝数:5000、500、50copies/Well 3种

循环数:45

 


  Alpha (B.1.1.7)突变株:QHN001(N501Y突变

SARS-CoV-2 N501Y Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 N501Y突变检测试剂盒

5,000 copies

500 copies

50 copies

Alpha型

(含N501Y突变)

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对于含有N501Y突变的alpha (B.1.1.7)突变株,利用突变株检测用“N501Y Mutant type Primer/Probe”,可以确认到扩增信号。另外,在常规株(突变)检测用的“501N Wild type Prime&Probe”中未观察到扩增,由此判断为N501Y突变株。



②Beta (B.1.351)突变株:TY8-612(N501Y突变、E484K突变)

SARS-CoV-2 N501Y Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 N501Y突变检测试剂盒

5,000 copies

500 copies

50 copies

Beta型:TY8-612

(N501Y 突变,E484K 突变)

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SARS-CoV-2 N501Y Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 N501Y突变检测试剂盒

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常规株(突变)检测用的“501N Wild type Prime/Probe”,5,000 copies的条件下可观察到轻微的扩增信号,但突变株的可以在更低Ct值下检测到,由此判断为N501Y突变株。在复制500 copies和50 copies条件下,未检测到常规株(非突变)的扩增信号。

③Gamma (P.1)突变株:TY7-501(N501Y突变、E484K突变)


SARS-CoV-2 N501Y Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 N501Y突变检测试剂盒


5,000 copies

500 copies

50 copies

Gamma型

(N501Y 突变,E484K 突变)

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SARS-CoV-2 N501Y Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 N501Y突变检测试剂盒

对于含有N501Y突变的巴西株突变株,利用突变株检测用的“N501Y Mutant type Primer/Probe”,可以确认到扩增信号

常规株(突变)检测用的“501N Wild type Prime&Probe”,在复制5,000 copies的条件下可观察到扩增信号,但突变株的可以在更低Ct值下检测到,由此判断为N501Y突变株。在500 copies500copies的条件下,未能检测到常规株(非突变)的扩增信号。

④VR-1986HK(N501Y无突变、E484K无突变)

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5,000 copies

500 copies

50 copies

无突变

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对于不含N501Y突变和E484K突变的VR-1986HK利用常规株(非突变)检测用的“501N Wild type Primer/Probe”,可以确认到扩增信号。在突变株检测用的“N501Y Mutant type Prime/Probe”中未观察到扩增,由此判断为常规株的突变株。

PCR反应条件

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常规株以及突变株的基因型

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产品列表

产品编号

产品名称

包装

283-35703

SARS-CoV-2 N501Y Mutation Detection Kit
SARS-CoV-2 N501Y 突变检测试剂盒

20次反应用

287-35701

供200次反应用

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产品名称

包装

281-35601

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit
SARS-CoV-2 E484K突变检测试剂盒

供200次反应用

285-33801

SARS-CoV-2 RT-qPCR Detection Kit Ver.2
SARS-CoV-2 RT-qPCR检测试剂盒Ver.2

供200次反应用

281-34501

SARS-CoV-2 Lysis buffer Ver.2
SARS-CoV-2 裂解缓冲液 Ver.2

供200次反应用

FAQ

Q:能否判定新冠病毒阳性/阴性?

A:本试剂盒检测阳性样品中是否存在基因突变,无法判定阳性/阴性。

Q:能否检测用直接PCR法简单提取的RNA样品?

A本试剂盒无法检测简单提取的RNA。请使用RNA提取/纯化试剂盒等生成的RNA。

      离心柱:ISOSPIN Viral RNA(产品编号: 310-08931, 日本基因)

      自动核酸提取仪:QuickGene-Auto 12S/24S(倉敷紡績,还需要QuickGene AutoS RNA Virus Kit)

Q:试剂盒包装“200 Reactions”是什么意思?

A:【200 Reactions】是指实时PCR可以分开200孔进行。1个样品需要2个孔,即100个样品。

 ①    含有常规株的Primer&Probe的孔

 ②    含有突变株的Primer&Probe的孔

Q:试剂盒中是否包含病毒的阳性对照RNA?

A:本试剂盒不含阳性对照。若有需要,请向FUJIFILM Wako客服咨询。

Q:当野生株和突变株的扩增曲线均起峰时,应如何判断?

A如果病毒量高,无论是突变株样品,还是野生株,都有可能在其Primer&Probe中观察到扩增信号。然而,在此情况下,突变株的扩增信号上升

      得更快(Ct值小)。请务必通过突变株和常规株用的两种Primer&Probe进行检测,以确定 Ct 值的差异。

Q:是否存在E484K单独突变?

A不含N501Y突变、但含E484K突变的E484K单独突变株,已被确认为R.1株。但目前的信息较少,日本国立传染病研究所认为它是需要关注的突

      株(VOI),而不是高关注突变株(VOC)。


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SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

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SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit
SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

  • 产品特性
  • 相关资料
  • Q&A
  • 参考文献

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit

SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

试剂盒组成

20 Reactions

RT酶混合物(20×)

20 µL x 1支

一步反应混合物(2×)

200 μL x 1支

484E Wild Type Primer & Probe   Mixture(probe:FAM)
484E野生型引物&探针混合物(探针:FAM)

10 µL x 1支

E484K Mutant Type Primer & Probe   Mixture(probe:FAM)
E484K突变型引物&探针混合物(探针:FAM)

10 µL x 1支

200 Reactions

RT酶混合物(20×)

200 µL x 1支

一步反应混合物(2×)

1 mL x 2支

484E Wild Type Primer & Probe   Mixture(probe:FAM)
484E野生型引物&探针混合物(探针:FAM)

100 µL x 1支

E484K Mutant Type Primer & Probe   Mixture(probe:FAM)
E484K突变型引物&探针混合物(探针:FAM)

100 µL x 1支

背景

新冠病毒突变株在世界范围内不断扩散,感染人数也在不断增多。

有报告指出,新冠病毒Beta(B.1.351)突变株和Gamma(P.1)突变株含有的E484K突变或会逃避免疫,使疫苗的效果降低1-3)


※ Beta(B.1.351)突变株:在南非首次发现的突变株

※ Gamma(P.1)突变株:在巴西首次发现的突变株

 

通过FUJIFILM Wako开发的Primer设计技术,可以高灵敏检测难以被检测的基因点突变。本产品是快速简便检测E484K突变的试剂盒。

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

特点

判定容易

通过比较使用突变株与野生株Primer/Probe Set时的Ct值来判定

一步法RT-qPCR快速检测突变

约70 min即可完成

使用FUJIFILM Wako研发的Primer/Probe,高灵敏检测突变

所有突变株均可在相同的反应条件下检测

由于N501Y、E484K、L452R、E484Q的PCR反应条件均相同,可在同一个96孔板中进行检测。

 

 

检测原理

采用TaqMan®探针的一步法RT-qPCR。

利用FUJIFILM Wako开发的Primer,高灵敏度检测点突变。

▼使用前

病毒RNA量较多情况下,在突变株中使用常规株(非突变)检测用“484E Wild type Primer & Probe Mixture”,也可以观察到扩增信号。务必使用常规株(非突变)检测用的“484E Wild type Primer & Probe Mixture”和突变株检测用的“E484K Mutant Type Primer & Probe Mixture”两种试剂进行检测。

比较两个Ct值,若突变株检测用“E484K Mutant Type Primer & Probe Mixture”的Ct值小,则可判断病毒为E484K突变株。

突变株的检测应用数据

本试剂盒已经检出以下3种新冠病毒(SARS-CoV-2)株。

● Gamma株(P.1)突变株(TY7-501、E484K突变N501Y突变,由日本国立感染症研究所提供)

● Beta株(B.1.351)突变株(TY8-612、E484K突变、N501Y突变,由日本国立感染症研究所提供)

● Alpha株(B.1.1.7)突变株(QHN001、E484K无突变N501Y突变,由日本国立感染症研究所提供)

● VR-1986HK(E484K无突变N501Y突变ATCC)

样品拷贝份数:5000、500、50 copies/Well

循环数:45

 


 gamma(P.1)株:TY7-501(E484K突变、N501Y突变)

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5000 copies

500 copies

50 copies

Gamma株

(含有E484K突变)

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对于含有E484K突变的gamma株(P.1)突变株,使用突变株检测用的“E484K Mutant type Primer & Probe”,可以确认到扩增信号

常规株(非突变)检测用的“484E Wild type Primer & Probe”,在5000 copies的条件下可以观察到扩增信号,但可以在更低Ct值下检测到突变株,由此判断为E484K突变株。在500 copies和50 copies的条件下,未能检测到常规(非突变)的扩增信号。



 Beta株(B.1.351):TY8-612(E484K突变、N501Y突变)

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5000 copies

500 copies

50 copies

Beta株

(含有E494K突变)

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对于含有E484K突变的beta株(B.1351)突变株,使用突变株检测用的“E484K Mutant type Primer/Probe”,可以确认到扩增信号

常规株(非突变)检测用的“484E Wild type Primer/Probe”,在5000 copies的条件下可观察到轻微的扩增信号,但可以在更低的Ct值下检测到突变株,由此判断为E484K突变株。在500 copies和50 copies的条件下,未能检测到常规(非突变)的扩增信号。



 Alpha株(B.1.1.7):QHN001(E484K无突变N501Y突变)

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5000 copies

500 copies

50 copies

alpha株

(含有E484K突变)

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对于不含E484K突变的alpha株(B.1.1.7)突变株,利用常规(非突变)检测用的“484E Wild type Primer&Probe”,可以确认到扩增信号

突变株检测用的“E484K Mutant type Primer&Probe”,在5000copies的条件下可观察到扩增信号,但可以在更低的Ct值下检测到常规(非突变),由此判断为常规株的突变株。在500 copies和50 copies的条件下,未能检测到突变株的扩增信号。

 


④ VR-1986HKE484K无突变N501Y无突变)

SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 E484K 突变检测试剂盒

5000 copies

500 copies

50 copies

无突变

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对于不含N501Y突变和E484K突变的VR-1986HK,利用常规(非突变)检测用的“484E Wild type Primer&Probe”,可以确认到扩增信号

关于突变株检测用的“E484K Mutant type Primer&Probe”,在5000 copies的条件下可观察到扩增信号,但可以在更低的Ct值下检测到常规(非突变),由此判断为常规株的突变株。在500 copies和50 copies的条件下,未能检测到突变株的扩增信号。

PCR反应条件

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◆常规株以及突变株的基因型

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FAQ

Q:能否判定新冠病毒阳性/阴性?

A:本试剂盒检测阳性样品中是否存在基因突变,无法判定阳性/阴性。

Q:能否检测用直接PCR法简单提取的RNA样品?

A本试剂盒无法检测简单提取的RNA。请使用RNA提取/纯化试剂盒等生成的RNA。

      离心柱:ISOSPIN Viral RNA(产品编号: 310-08931, 日本基因)

      自动核酸提取仪:QuickGene-Auto 12S/24S(倉敷紡績,还需要QuickGene AutoS RNA Virus Kit)

Q:试剂盒包装“200 Reactions”是什么意思?

A:【200 Reactions】是指实时PCR可以分开200孔进行。1个样品需要2个孔,即100个样品。

 ①    含有常规株的Primer&Probe的孔

 ②    含有突变株的Primer&Probe的孔

Q:试剂盒中是否包含病毒的阳性对照RNA?

A:本试剂盒不含阳性对照。若有需要,请向FUJIFILM Wako客服咨询。

Q:当野生株和突变株的扩增曲线均起峰时,应如何判断?

A如果病毒量高,无论是突变株样品,还是野生株,都有可能在其Primer&Probe中观察到扩增信号。然而,在此情况下,突变株的扩增信号上升

      得更快(Ct值小)。请务必通过突变株和常规株用的两种Primer&Probe进行检测,以确定 Ct 值的差异。

Q:是否存在E484K单独突变?

A不含N501Y突变、但含E484K突变的E484K单独突变株,已被确认为R.1株。但目前的信息较少,日本国立传染病研究所认为它是需要关注的突

      株(VOI),而不是高关注突变株(VOC)。

参考文献

1.

Nelson, G., Buzko, O., Spilman, P., Niazi, K., Rabizadeh, S., Soon-Shiong, P. : bioRxiv (2021). doi:https://doi.org/10.1101/2021.01.13.426558

2.

 Jangra, S., Ye, C., Rathnasinghe, R., Stadlbauer, D., PVI study group, Krammer,F., Simon, V., Martinez-Sobrido, L., García-Sastre, A., Schotsaert, M. : medRxiv (2021). doi:https://doi.org/10.1101/2021.01.26.21250543

3.

Wang, Z. et al. : Nature (2021). doi:10.1038/s41586-021-03324-6


产品列表

产品编号 产品名称 产品规格 产品等级 备注
287-35603 SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit 
SARS-CoV-2 E484K突变检测试剂盒
20 Reactions
281-35601 SARS-CoV-2 E484K Mutation Detection Kit 
SARS-CoV-2 E484K突变检测试剂盒
200 Reactions

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