人类 TaqMan? Copy Number Reference Assays 在双重实时荧光定量 PCR 反应中与人类 TaqMan? Copy Number Assays 搭配使用,以检测和测量人类基因组中的拷贝数变异 (CNV) 和较小区域。提供两种可用作人类内源性参比基因的基因选项:RNase P 和 TERT。TaqMan? Copy Number Reference Assays 设计为参比基因组组装 (Build 37/Hg19) 中独特的基因组序列,并且是拷贝数靶标的相对定量所必需的。
TaqMan? Copy Number Assays 对目标基因进行定量,并标准化为一种已知存在于二倍体基因组的两个拷贝中的内源性参比基因。请注意,TaqMan? Copy Number Reference Assays 具有种属特异性。
TERT:替代参比基因选项
TaqMan? Copy Number Reference Assays 具有 VIC? 染料–标记的 TAMRA? 探针和参比序列–特异性正向和反向引物。这些Assay不受引物限制。推荐将
TaqMan? Copy Number Reference Assay RNase P 作为拷贝数分析的标准参比Assay。该Assay检测染色体 14、cytoband 14 q11.2 上的核糖核酸酶 P RNA 成分 H1 (H1RNA) 基因 (RPPH1)。Assay位置是 chr.14:20811565在 NCBI Build37 上。它具有87 bp 扩增子,该扩增子映射于单个外显子 RPPH1 基因内。
TaqMan? Copy Number Reference Assay TERT 是一个替代参比Assay;如果由于染色体畸变或其他问题,RNase P 测定样本的功能很差,推荐使用该Assay。该Assay以位于染色体5、cytoband 5 p15.33 上的端粒酶逆转录酶 (TERT) 基因为靶标。Assay位置是 chr.5:1253373在 NCBI Build37 上。它具有 88 bp 扩增子,该扩增子映射于 TERT 基因的外显子16内。
较简单的拷贝数分析工作流程
TaqMan? Copy Number Assays 具有当前所有拷贝数分析方法的较简单工作流程。将试验Assay(FAM? 染料–标记的)、参比Assay(VIC? 染料–标记的)、您的样品 DNA 与 TaqMan? Master Mix 组合,然后使用标准 TaqMan? Copy Number Assay 方案,在 Applied Biosystems? 实时荧光定量 PCR 系统上运行。平均来说,设置到一级分析仅需3–4小时(包括约2小时 PCR 运行)
。强大的数据分析软件
CopyCaller? Software 专为 TaqMan? Copy Number Assay 数据分析而开发。这款免费、易于使用的软件采用图形界面,可快速计算运行中一组样品的可能拷贝数。它还为每个拷贝数的检出提供了置信度,并具有异常值检查功能。
仅供科研使用。不可用于人或动物的治疗或诊断。