金畔生物试剂,VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

快速、高检出的华大平台RNA建库试剂盒

VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

快速:简单的操作流程,使得转录组建库时间缩短至4.5 h

兼容:针对低质量样本,有更高的建库成功率

高质:基因检出率高,转录本区域的覆盖度均一

VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

1. 不同物种、不同起始量模板

以动物(人体血液、293 T细胞),细菌(大肠杆菌),植物(拟南芥、大豆)Total RNA为模板,根据物种的不同分别选择N406(动物rRNA去除产品),N407(细菌rRNA去除产品),N408(rRNA及珠蛋白mRNA去除产品)和N409(植物rRNA去除产品)进行rRNA去除。随后参照NRM605和A公司同类型产品的建库流程进行链特异性转录组文库构建,结果显示使用Vazyme # NRM605建库相较竞品均具有明显的产量优势。

VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

图1. 不同物种和投入量下NRM605构建的文库产量

 

物种

NRM605峰型

239 T

VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

拟南芥

VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

黄豆

VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

图2. 不同物种在不同投入量下构建的文库峰型

 

2. 兼容低质量样本

以低质量FFPE样本(RIN值为2.3)为起始模板,投入量为200ng,使用VAHTS® Ribo-off rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)(Vazyme,# N406)进行rRNA去除,再分别以NRM605、A、B的建库全组分按照各自的说明书进行操作,进行链特异转录组建库。结果显示:从产量上看,Vazyme# NRM605>A>B,Vazyme# NRM605 具有明显的产量优势。

文库产量

NRM605峰型

VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

图3. 在不同公司产品对低质量样本建库的文库产量

 

3. 基因检出率高

以293T细胞 Total RNA为起始模板,分别使用VAHTS® mRNA Capture Beads(Vazyme,# N401,mRNA抓取模块,Input RNA量分别为1μg/100ng/10ng)和Ribo-off rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)(Vazyme,# N406,rRNA去除模块,Input RNA量分别为1μg/100ng/10ng)进行前处理,随后使用NRM605、A公司及B公司同类产品进行链特异性转录组文库构建,经质控合格后的文库使用lllumina HiSeq X10平台进行PE150测序。对原始测序数据进行低质量读过滤,得到高质量的Clean Reads进行分析。结果显示:Vazyme# NRM605基因检出率优于其他产品。

VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

图4. 各公司产品基因检测数

VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI是针对MGI高通量测序平台定向开发的转录组文库构建专用试剂盒。试剂盒包含两种类型的cDNA二链合成Buffer,可根据需要选择普通转录组或链特异转录组建库。

试剂盒将二链合成、末端修复和dA-Tailing合并为一步,中间不需要纯化步骤,简化了操作流程,缩短了建库时间。优化的反应体系,提高了文库转化效率,能兼容更低起始投入量,对不同起始量的RNA都有均一的覆盖度。

本试剂盒利用磁珠分选的方式,可以快速获得特定长度的文库,能够满足不同实验的个性化需求。试剂盒包含的所有酶和缓冲液都经过了严格的质量控制和功能验证,较大程度上保证了文库构建的稳定性重复性。

VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

 

VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。

金畔生物试剂,VAHTS Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina

VAHTS® Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina

快速转录组文库构建试剂盒

VAHTS Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina

快速:简单的操作流程,使建库时间缩短了 2 h

兼容:兼容多种 RNA 富集模块,随心搭配

通用:灵活自由的选择链特异或非链特异文库

VAHTS Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina

1.数据质量佳

VAHTS Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina

以1 μg 以及50 ng 的293T 细胞总RNA起始,分别使用Vazyme 的NR604 以及K*、N*、A* 公司的试剂盒构建链特异性RNA文库,质控合格后的文库使用Illumina Hiseq X 10 平台进行PE150 测序。

结果显示: Vazyme 的数据质量在同类产品中处于优势地位。

 

2.Mapping率高

VAHTS Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina

 

与其他同类产品相比,Vazyme 在Mapping率上表现更加优异。

 

3.基因检出数多

VAHTS Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina

与其他同类产品相比,Vazyme 在基因检出数上表现更加丰富。

 

4.文库均一性好

VAHTS Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina

本产品构建的文库数据分布均匀,没有5’或3’偏好性,并且与市面上同类产品高度一致。

VAHTS Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina

VAHTS® Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina是针对Illumina高通量测序平台定向开发的转录组文库构建专用试剂盒。试剂盒包含两种类型的cDNA二链合成Buffer,可根据需要选择进行普通转录组或链特异转录组建库。

试剂盒将二链合成、末端修复和dA-Tailing合并为一步,中间不需要纯化步骤,简化了操作流程,缩短了建库时间。优化的反应体系,提高了文库转化效率,能兼容更低起始投入量,对不同起始量的RNA都有均一的覆盖度。

本试剂盒利用磁珠分选的方式,可以快速获得特定长度的文库,能够满足不同实验的个性化需求。试剂盒包含的所有酶和缓冲液都经过了严格的质量控制和功能验证,较大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。

VAHTS Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina

组分 NR604-01 (24 rxns) NR604-02 (96 rxns)
Frag/Prime Buffer 468 μl 2 × 936 μl
Actinomycin D (5mg/ml) 24 μl 96 μl
1st Strand Buffer 2 144 μl 576 μl
1st Strand Enzyme Mix 2 48 μl 192 μl
2nd Strand Buffer 2 (with dNTP) 600 μl 4 × 600 μl
2nd Strand Buffer 2 (with dUTP) 600 μl 4 × 600 μl
2nd Strand Enzyme Super Mix 360 μl 2 × 720 μl
Rapid Ligation Buffer 3 600 μl 4 × 600 μl
Rapid DNA Ligase 2 120 μl 480 μl
PCR Primer Mix 3 120 μl 480 μl
VAHTS® HiFi Amplification Mix 600 μl 4 × 600 μl
Heat-labile UDG 24 μl 96 μl

VAHTS Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina

-30°C~-15°C保存

金畔生物试剂,VAHTS Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

VAHTS® Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

VAHTS Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

快速:简单的操作流程,使建库时间缩短了 2 h

兼容:兼容多种 RNA 富集模块,随心搭配

通用:灵活自由的选择链特异或非链特异文库

VAHTS Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

VAHTS® Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for MGI是针对MGI高通量测序平台定向开发的转录组文库构建专用试剂盒。试剂盒包含两种类型的cDNA二链合成Buffer,可根据需要选择进行普通转录组或链特异转录组建库。试剂盒将二链合成、末端修复和dA-Tailing合并为一步,中间不需要纯化步骤,简化了操作流程,缩短了建库时间。优化的反应体系,提高了文库转化效率,能兼容更低起始投入量,对不同起始量的RNA都有均一的覆盖度。本试剂盒利用磁珠分选的方式,可以快速获得特定长度的文库,能够满足不同实验的个性化需求。试剂盒包含的所有酶和缓冲液都经过了严格的质量控制和功能验证,较大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。

VAHTS Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

组分

NRM604-01 (24 rxn)

NRM604-02 (96 rxn)

Frag/Prime Buffer

468 μl

2 × 936 μl

Actinomycin D (5mg/ml)

24 μl

96 μl

1st Strand Buffer 2

144 μl

576 μl

1st Strand Enzyme Mix 2

48 μl

192 μl

2nd Strand Buffer 2 (with dNTP)

600 μl

4 × 600 μl

2nd Strand Buffer 2 (with dUTP)

600 μl

4 × 600 μl

2nd Strand Enzyme Super Mix

360 μl

2 × 720 μl

Rapid Ligation Buffer 3

600 μl

4 × 600 μl

Rapid DNA Ligase 2

120 μl

480 μl

PCR Primer Mix 3

120 μl

480 μl

VAHTS® HiFi Amplification Mix

600 μl

4 × 600 μl

Heat-labile UDG

24 μl

96 μl

VAHTS Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for MGI

-30 ~ -15℃保存。

金畔生物试剂,VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina V2

VAHTS® Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina V2

链特异性转录组文库构建专用试剂盒

VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina V2

链特异性文库:保留转录的方向性

优化的反应体系:物种类型兼容广

更宽模板兼容范围:RNA起始量可低至50 ng

简单的建库流程:一天完成文库构建及质检

VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina V2

Sample

Read_length

Raw_reads

Clean reads

Q20

Q30

Adapter

rRNA_Rate

Expression Gene

NR612-1

150 bp

17812848

16469770

96.91%

92.55%

7.54%

0.43%

28733

NR612-2

150 bp

17812116

16828594

97.34%

93.33%

5.52%

0.44%

29136

N

150 bp

17812520

16073548

96.49%

91.75%

9.76%

0.44%

28796

K

150 bp

17812772

16406916

96.22%

91.48%

7.89%

0.56%

28389 

A

150 bp

20047106

12589976

96.95%

92.89%

37.20%

0.34%

26120

 

表1.以1μg的293T细胞总RNA起始,分别以VAHTS® Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina V2 (vazyme#NR612),N,K,A公司的链特异性mRNA试剂盒构建文库,质控后的文库用illumina Hiseq X ten PE150测序,从基本的下机数据上看A公司的文库接头残余率高达37%且基因检出数明显偏低,Vayme,N,K三个公司的在基因检出数及其他各项指标上表现较一致。

文库均一性分析

VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina V2

图1.以1 μg的293T细胞总RNA起始,分别以VAHTS® Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina V2(Vazyme#NR612),N,K,A公司的链特异性mRNA试剂盒构建文库,从图中可看出NR612,N,K,A四款RNA建库试剂盒的文库均一性都较高,没有5’或3’的偏好性。

基因组分布情况分析

VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina V2

 

图2. 将NR612,N,K,A 的下机数据比对到人参考基因组上的Reads 进行统计,从图中可看出Vazyme,N,A 比对到exon,utr,intronic,intergenic 区域的总Reads 数基本一致,K 文库比对exon 区域的数据占比偏低且比对到intronic 区的数据偏高。

VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina V2

VAHTS® Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina v2是针对Illumina高通量测序平台定向开发的链特异性转录组文库构建专用试剂盒。本试剂盒适用于起始模板量为0.05-4 μg完整度良好的动、植物及真菌等真核生物的总RNA的链特异转录组文库构建,与常规转录组建库不同的是在第二链合成时底物掺入了dUTP,并在PCR扩增富集文库前将带U标记的第二链模板用UDG酶消化,确保了测序信息都来自于第一链cDNA,从而保留了mRNA的链方向性,后期数据分析可确定转录本是来自DNA的正义还是反义链。

本试剂盒是VAHTS® Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina的升级产品,该版本简化了操作流程,提高了文库转化效率,兼容更低起始投入量,利用磁珠分选的方式,可以快速获得特定长度的文库,满足不同实验的个性化需求。

试剂盒包含的所有酶和缓冲液都经过了严格的质量控制和功能验证,较大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。

VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina V2

Box1:2 ~ 8℃保存;2 ~ 8℃运输。Box2:-30 ~ -15℃保存;-20 ~ 0℃运输。

Box2:-30 ~ -15℃保存;-20 ~ 0℃运输。

金畔生物试剂,VAHTS Small RNA Library Prep Kit for Illumina

VAHTS® Small RNA Library Prep Kit for Illumina

small RNA-seq文库构建试剂盒

VAHTS Small RNA Library Prep Kit for Illumina

样本兼容范围广:

种类广:动、植物细胞/组织总RNA,分离纯化的small RNA,以及其他类型的总RNA(如外泌体总RNA),均可作为起始模板;

起始量广:兼容100 ng-1 μg总RNA的投入量。

文库丰度高:

接头污染少,有效文库比例高,miRNA比例高、涵盖种类多。

多种纯化方式可选:

试剂盒包含文库构建所需的所有组分,提供磁珠分选和PAGE胶分离两种文库纯化方式,可根据初始文库质量任意选择。

精心优化的反应体系:

单管操作,文库产量高,平行重复相关性好。

VAHTS Small RNA Library Prep Kit for Illumina

VAHTS Small RNA Library Prep Kit for Illumina

VAHTS Small RNA Library Prep Kit for Illumina

VAHTS Small RNA Library Prep Kit for Illumina

 

图A:以1 μg小鼠肝脏总RNA为起始模板的small RNA文库;

图B:以1 μg小鼠肝脏总RNA为起始模板的small RNA文库经PAGE分离后的最终文库;

图C:以80 ng HeLa细胞培养物上清外泌体总RNA为起始模板的samll RNA文库。

VAHTS Small RNA Library Prep Kit for Illumina

VAHTS® Small RNA Library Prep Kit for Illumina是针对Illumina高通量测序平台定向开发的small RNA文库构建专用试剂盒。本试剂盒适用于模板起始量为0.1-1 μg的动、植物总RNA,以及分离纯化的small RNA。small RNA的3’和5’端分别连上通用接头,再经过逆转录、PCR扩增以及PAGE胶或磁珠纯化等步骤,得到适用于Illumina平台的测序文库。试剂盒包含文库构建及纯化所需的所有酶和缓冲液,所有组分都经过了严格的质量控制和功能验证,较大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。

VAHTS Small RNA Library Prep Kit for Illumina

VAHTS Small RNA Library Prep Kit for Illumina

VAHTS Small RNA Library Prep Kit for Illumina

RL5 Adaptor,-85 ~ -65℃保存,干冰运输;
Filtration Column,15 ~ 25℃保存,室温运输;
其余组分,-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。

金畔生物试剂,VAHTS RNA Multi-PCR Library Prep Kit

VAHTS RNA Multi-PCR Library Prep Kit

操作简便:采用两轮 PCR 方法,全流程低至 5 h

优异的覆盖度:定制的 Panel 对病毒全基因组的覆盖度达到 99.7%

VAHTS RNA Multi-PCR Library Prep Kit

VAHTS®  RNA Multi-PCR Library Prep Kit是基于多重扩增建库原理,用于测序分析病毒RNA基因组遗传信息的试剂盒。本试剂盒包含完整逆转录模块和多重PCR扩增建库模块,其中文库构建采用两轮PCR方法,完成基因组靶向扩增及富集。从获得病毒基因组样本到完整上机文库全流程耗时低至5 h,其中手动操作时间小于1.5 h。本产品兼容起始模板范围16 – 38 CT,构建好的文库适用于Illumina高通量测序平台进行测序分析。

本试剂盒定制的Panel对病毒全基因组的覆盖度达到99.7%,能够有效地用于检测出基因组突变及缺失位点。本试剂盒的优化组合使结果更加稳定、可靠,帮助研究者和检测人员简便、快速、高质量地完成病毒RNA建库。试剂盒中提供的所有试剂均经过了严格的质量控制和功能验证,较大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。

VAHTS RNA Multi-PCR Library Prep Kit

1. 广泛的样本投入量

以不同拷贝数的病毒 RNA 为起始模板,参照 NA211、A、B、C公司同类产品的建库流程进行文库构建,使用 Qubit 检测文库浓度。

VAHTS RNA Multi-PCR Library Prep Kit

图1. 不同投入量下的文库产量

在不同模板投入量下(病毒 RNA 的 CT 值分别为 20.6、23.8、26.7、30.4、34.2、38.1),NA211 均能高效建库。

 

2. 优异的覆盖度

以不同拷贝数的病毒 RNA 为起始模板,参照 NA211、A、C公司同类产品的建库流程进行文库构建,PE150 测序,测序数据量10 M Clean reads 进行分析。

VAHTS RNA Multi-PCR Library Prep Kit

图2. 不同投入量下的文库覆盖度

在不同模板投入量下,NA211表现出优异的病毒全基因组的覆盖度。CT=16-30,测序覆盖度>99%;CT=30-32,测序覆盖度>98%;CT=32-38,样本可检出。

VAHTS RNA Multi-PCR Library Prep Kit

VAHTS RNA Multi-PCR Library Prep Kit

VAHTS RNA Multi-PCR Library Prep Kit

-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。

金畔生物试剂,Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

快速:操作简便,全流程只需1 h

兼容:兼容不同物种——人、小鼠、大鼠;兼容低起始量样本——低至10 ng;兼容低质量样本——如FFPE样本

高效:rRNA去除效率高,rRNA残留率<10%

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit(Human/Mouse/Rat)适用于去除人、小鼠和大鼠总RNA中的rRNA(包括细胞质28S,18S,5S rRNA以及线粒体12S,5.8S rRNA),保留mRNA及其它非编码RNA;该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本(例如FFPE样本),得到的RNA可用于mRNA和非编码RNA(例如lncRNA)分析。

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

1. 不同物种兼容性测试

以293 total RNA、Mouse total RNA、Rat total RNA为起始模板,投入量为100 ng,分别进行不去除和使用Vazyme #N420、Vazyme #N406进行rRNA去除。随后均使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行转录组文库构建,并对高质量的Clean Reads进行分析。

 

(1)rRNA残留率

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

(2)基因检出

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

结果显示:针对不同物种,Vazyme #N420的兼容性高,rRNA残留率低于10%,具有丰富的基因检出数。

 

2. 不同起始量兼容性测试

以293 total RNA为起始模板,投入量分别为1 μg、100 ng、10 ng。分别进行不去除和使用Vazyme #N420、Vazyme #N406进行rRNA去除。随后均使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行转录组文库构建,并对高质量的Clean Reads进行分析。

(1)rRNA残留率

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

 

(2)基因检出

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

结果显示:针对不同起始量样本,Vazyme #N420的兼容性高,rRNA残留率均低于5%,具有丰富的基因检出数。

 

3. FFPE样本兼容性测试

以FFPE标准品为起始模板,投入量为200 ng,分别进行不去除和使用Vazyme #N420、Vazyme #N406进行rRNA去除。随后均使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行转录组文库构建,并对高质量的Clean Reads进行分析。

 

(1)rRNA残留率

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

(2)基因检出

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

结果显示:针对FFPE样本,Vazyme #N420的兼容性高,具有丰富的基因检出数。

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

BOX 1,-30~-15℃保存,0℃运输;

BOX 2,2~8℃保存,根据不同目的地调整运输方式。

金畔生物试剂,Ribo-off rRNA Depletion Kit V2 (Bacteria)

Ribo-off® rRNA Depletion Kit V2 (Bacteria)

升级版革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌的rRNA去除

Ribo-off rRNA Depletion Kit V2 (Bacteria)

快速与实力并存:优化体系,保证rRNA去除效率的同时流程上缩短至1h

适用范围广:物种覆盖度提升,适用物种更广泛。

Ribo-off rRNA Depletion Kit V2 (Bacteria)

Ribo-off® rRNA Depletion Kit V2 (Bacteria) 是针对革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌总RNA中去除rRNA的试剂盒。总RNA样本经过rRNA与探针杂交、RNase H消化、DNase I消化等步骤,将rRNA(包括16S和23S rRNA)从总RNA中去除,保留mRNA以及其它非编码RNA;该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本 (例如FFPE RNA),得到的RNA可用于mRNA和非编码RNA (例如IncRNA)分析。

Ribo-off rRNA Depletion Kit V2 (Bacteria)

1. 不同起始量模板

以枯草芽孢杆菌为起始模板,投入量为1 μg/100 ng/10ng,分别进行不去除和使用Vazyme #N417、Vazyme #N407、A公司和B公司同类产品进行rRNA去除,随后均使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行转录组文库构建。通过对高质量的Clean Reads进行分析。结果显示在不同投入量下,Vazyme #N417去除rRNA效率均优于N407及其他品牌试剂,并在10 ng低投入量下优势尤为显著。

Ribo-off rRNA Depletion Kit V2 (Bacteria)

图1. 不同起始量下rRNA去除情况

 

2. 物种兼容性测试

解淀粉芽孢杆菌、格式芽孢杆菌、变异链球菌等使用Vazyme #N417进行rRNA去除,随后均使用Vazyme #NR605进行转录组文库构建。通过对高质量的Clean Reads进行分析。结果显示:Vazyme #N417可兼容多物种的rRNA去除。

Ribo-off rRNA Depletion Kit V2 (Bacteria)

图2. 不同物种使用Vazyme #N417的rRNA去除情况

 

3. 复杂样本兼容性测试

以土壤提取RNA为测试样本为起始模板,分别进行不去除和使用Vazyme #N417、Vazyme #N407、A公司和B公司同类产品进行rRNA去除;使用Vazyme #NR605进行转录组文库构建,通过对得到高质量的Clean Reads进行分析。结果显示:Vazyme #N417 的rRNA残留率明显低于Vazyme #N407、A及B公司品牌,并且在已检出菌种上,rRNA残留率多低于其他品牌,说明Vazyme #N417能够覆盖更多菌种的rRNA去除。

Ribo-off rRNA Depletion Kit V2 (Bacteria)

*使用Silva数据库进行rRNA 残留分析,对于top 10 菌种的 rRNA残留率进行展示。

表1. 土壤样本的rRNA残留情况

 

4. 基因检出率

Vazyme #N417搭配使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)中的进行转录组文库构建。在基因检出数指标上,与Vazyme #N407和B同类产品一致,优于A同类产品,保证了丰富的基因检出数。

Ribo-off rRNA Depletion Kit V2 (Bacteria)

图3. 各品牌产品基因检测数

 

Ribo-off rRNA Depletion Kit V2 (Bacteria)

Ribo-off rRNA Depletion Kit V2 (Bacteria)Ribo-off rRNA Depletion Kit V2 (Bacteria)

-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。

金畔生物试剂,Ribo-off Globin & rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-off® Globin & rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

珠蛋白(Globin) mRNA及rRNA去除试剂盒

Ribo-off Globin &amp; rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

低质量RNA样本高效去除效率

起始量低至 10 ng

Ribo-off Globin &amp; rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-off® Globin & rRNA Depletion Kit(Human/Mouse/Rat)是针对血液样本总RNA中去除珠蛋白(Globin)mRNA及rRNA的试剂盒。本试剂盒适用于起始模板量为0.01 – 1 μg的血液总RNA,总RNA样本经过Globin mRNA和rRNA与探针杂交、RNase H消化、DNase I消化等步骤,将Globin mRNA及rRNA(包括细胞质rRNA和线粒体rRNA)从总RNA中去除,保留其它mRNA以及非编码RNA,可用于LncRNA等非编码RNA的分析;本试剂盒可兼容部分降解的RNA样本,所得到的产物适用于RNA文库构建及其它实验。

Ribo-off Globin &amp; rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

1. 不同物种、不同起始量模板

以Human、Mouse 以及 Rat Blood RNA 为起始模板,分别进行不去除和使用 N408、N*公司(#E7***L)、K*公司(K***78)同类产品进行 rRNA 去除,随后均使用 VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(NR605)进行链特异性转录组文库构建。经测序分析rRNA与Globin mRNA在下机数据中的占比。评判指标:rRNA ratio≤5%+1%;Globin mRNA ratio ≤1%+0.5%。
 

不同起始量(Human)

Ribo-off Globin &amp; rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

不同物种(100 ng)

Ribo-off Globin &amp; rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

图1. 不同起始量、不同物种Globin mRNA及rRNA去除情况

结果表明:不同起始量(1 µg-10 ng)、不同物种的样本,N408均能高效去除目标 RNA。

 

2. 不同RIN值模板

以100 ng不同RIN值的Human Blood RNA为起始模板,分别进行不去除和使用N408、N*公司(#E7***L)、K*公司(K***78)和 Q*公司(3***80)同类产品进行 rRNA 去除,随后均使用 VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行链特异性转录组文库构建。经测序分析rRNA与Globin mRNA在下机数据中的占比。

Ribo-off Globin &amp; rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

图2. 不同RIN值样本Globin mRNA及rRNA去除情况

Ribo-off Globin &amp; rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-off Globin &amp; rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-off Globin &amp; rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。

金畔生物试剂,Ribo-off rRNA depletion kit (Plant)

 Ribo-off® rRNA depletion kit (Plant)

植物去除rRNA试剂盒

Ribo-off rRNA depletion kit (Plant)

兼容性强:能兼容多种植物物种,同时针对植物的不同部位(根、种子和叶片)也具有良好的兼容性。

rRNA残留率低:针对不同物种均能有效去除rRNA

Ribo-off rRNA depletion kit (Plant)

1.低的rRNA残留率

Ribo-off rRNA depletion kit (Plant)

针对不同物种,Vazyme N409均能有效去除rRNA,较大程度减少rRNA的残留导致的数据浪费,且去除效率优于illumina同类产品。

2.优异的数据质量

Ribo-off rRNA depletion kit (Plant)

对下机数据过滤后得到的高质量clean reads,根据参考序列使用HISAT2软件对序列进行比对分析,得到mapping rate。Vazyme N409搭配后续的建库模块的下机数据,在Mapping rate上优于illumina。

Ribo-off rRNA depletion kit (Plant)

Ribo-off® rRNA depletion kit (Plant)是针对植物根、种子和叶片总RNA中去除rRNA的试剂盒。本试剂盒适用于模板起始量为1 – 5 μg的植物总RNA,总RNA样本经过rRNA与探针杂交、RNase H消化、DNaseⅠ消化等步骤,将rRNA(包括5S、18S和25S rRNA)从总RNA中去除,保留mRNA和其它非编码RNA,可用于LncRNA等非编码RNA的分析;试剂盒额外提供了靶向线粒体rRNA和叶绿体rRNA的消化探针,可以高效去除多种植物种属主要的rRNA,提供信息充实的测序结果。该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本,所得的产物适用于RNA文库及其他实验。

Ribo-off rRNA depletion kit (Plant)

组分 N409-01 (12 rxn) N409-02 (24 rxn)
rRNA Probe (Plant) 24 μl 48 μl
Probe Buffer 36 μl 72 μl
RNase H Buffer 48 μl 96 μl
RNase H 12 μl 24 μl
DNaseⅠBuffer 348 μl 696 μl
DNaseⅠ 12 μl 24 μl
Nuclease-free ddH2O 1 ml 2 × 1 ml

Ribo-off rRNA depletion kit (Plant)

-30°C~-15°C保存

金畔生物试剂,Ribo-off rRNA Depletion Kit (Bacteria)

Ribo-off®  rRNA Depletion Kit (Bacteria)

用于革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌的rRNA去除

Ribo-off rRNA Depletion Kit (Bacteria)

兼容绝大多数的革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌

高达97%的rRNA去除率

完整保留mRNA与lncRNA

Ribo-off rRNA Depletion Kit (Bacteria)

Ribo-off rRNA Depletion Kit (Bacteria)

以上表格为1 μg不同的细菌Total RNA同时用Ribo-off® rRNA Depletion Kit (Bacteria)(Vazyme #N407)和Ribo-Zero rRNA Removal Kit (Bacteria)  (Illumina,MRZB12424)去除rRNA,并用VAHTS® Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit(Vazyme #NR603)进行后续的文库构建,可以看出N407有优异的rRNA去除效率。

Ribo-off rRNA Depletion Kit (Bacteria)

Ribo-off® rRNA Depletion Kit (Bacteria)是针对革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌总RNA中去除rRNA的试剂盒。本试剂盒适用于起始量模板为1-5 μg的革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌总RNA,总RNA样本经过rRNA与探针杂交、RNase H消化、DNaseⅠ消化等步骤,最终将rRNA(包括16 S和23 S rRNA)从总RNA中去除,保留mRNA和其它非编码RNA,可用于LncRNA等非编码RNA的分析;该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本(例如FFPE RNA),所得的产物适用于RNA文库及其他实验。

Ribo-off rRNA Depletion Kit (Bacteria)

Ribo-off rRNA Depletion Kit (Bacteria)

Ribo-off rRNA Depletion Kit (Bacteria)

-20°C保存

金畔生物试剂,Ribo-off rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-off® rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

rRNA去除试剂盒

Ribo-off rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-off® rRNA Depletion Kit (H/M/R) 适用于去除人、小鼠和大鼠总RNA中的rRNA (包括细胞质28S, 18S,  5S rRNA以及线粒体12S, 5.8S rRNA),保留mRNA以及其它非编码RNA;该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本 (例如FFPE RNA),得到的rRNA-depleted RNA可用于mRNA和非编码RNA (例如lncRNA) 分析。

Ribo-off rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-off rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-off rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。

金畔生物试剂,VAHTS 2 × Frag/Prime Buffer

VAHTS® 2 × Frag/Prime Buffer

VAHTS 2 × Frag/Prime Buffer

增加了建库流程中的灵活性和可监测性

有效保证文库质量的可靠性

VAHTS 2 × Frag/Prime Buffer

本产品是针对Illumina高通量测序平台转录组文库构建定向优化的一款产品。在高温条件下,通过Mg2+作用将RNA随机打断至短片段,需配套Vazyme的VAHTS®系列RNA建库试剂盒使用。本产品适合在RNA样品已通过其他方式片段化,只需结合随机引物进行后续建库步骤时使用,也可以在打断之前对样品进行浓度检测,相比于1×Frag/Prime Buffer增加了建库流程中的灵活性和可监测性,有效保证文库质量的可靠性。

VAHTS 2 × Frag/Prime Buffer

组分 N402-01
VAHTS® 2 × Frag/Prime Buffer 936 μl

VAHTS 2 × Frag/Prime Buffer

-20℃保存

金畔生物试剂,VAHTS mRNA Capture Beads

 VAHTS® mRNA Capture Beads

mRNA分离磁珠

VAHTS mRNA Capture Beads

VAHTS® mRNA Capture Beads是偶联了Oligo (dT)的1 μm顺磁性微球,适合于从纯化的总RNA中分离poly (A)+ RNA。磁性分离技术可从小体积样品中分离出完整的mRNA,避免了mRNA沉淀的步骤。整个操作过程可在一小时内完成。

VAHTS mRNA Capture Beads

VAHTS mRNA Capture Beads

VAHTS mRNA Capture Beads

4 °C保存。

其他必需材料

磁力架

Nuclease-free PCR管

适用范围

适用于将poly (A)+ RNA从0.01 – 12.5 μg完整度良好的总RNA (RIN值应≥7)中分离出来,不完整或降解的总RNA模板会导致部分poly (A)+ RNA 信息的缺失 。

金畔生物试剂,VAHTS RNA Adapters set1/set2 for Illumina

VAHTS® RNA Adapters set1/set2 for Illumina

转录组建库专用接头

VAHTS RNA Adapters set1/set2 for Illumina

提供24种Index接头

每批次严格质量控制和功能验证

VAHTS RNA Adapters set1/set2 for Illumina

VAHTS RNA Adapters set1/set2 for Illumina

表1. VAHTS® RNA Adapters index 序列表

*单个RNA文库RNA Adapter使用量为2.5 μl。

N803-01和N804-01试剂盒中每种RNA Adapter包装量足够进行4个RNA文库构建,整个试剂盒足够进行48个RNA文库构建。

N803-02和N804-02试剂盒中每种RNA Adapter包装量足够进行16个RNA文库构建,整个试剂盒足够进行192个RNA文库构建。

VAHTS RNA Adapters set1/set2 for Illumina

VAHTS® RNA Adapters set1/set2 for Illumina适用于Illumina高通量测序平台转录组文库构建,兼容VAHTS® mRNA-seq v2 Library Prep Kit for Illumina (NR601),兼容VAHTS® Stranded mRNA-seqLibrary Prep Kit for Illumina(NR602), VAHTS® Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit for Illumina(NR603)。 Set1 (N803) 包含RNA Adapter 1-12共计12种不同Index接头; Set2 (N804) 包含RNA Adapter13-27 共计12种不同Index接头。 每批次接头都经过严格的质量控制和功能验证,较大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。

VAHTS RNA Adapters set1/set2 for Illumina

VAHTS RNA Adapters set1/set2 for Illumina

VAHTS RNA Adapters set1/set2 for Illumina

-20 °C保存。

金畔生物试剂,VAHTS RNA Adapters set3 – set6 for Illumina

 VAHTS® RNA Adapters set3 – set6 for Illumina

VAHTS RNA Adapters set3 - set6 for Illumina

提供24种Index接头

每批次严格质量控制和功能验证

VAHTS RNA Adapters set3 - set6 for Illumina

VAHTS® RNA Adapters set3 – set6 for Illumina是Illumina高通量测序平台文库构建专用配套试剂盒, 适用于Illumina高通量测序平台多样品RNA文库构建。set3试剂盒(N809)中包含RNA Adapter 96-01至RNA Adapter 96-24共计24种不同Index接头;set4试剂盒(N810)中包含RNA Adapter 96-25至RNA Adapter 96-48共计24种不同Index接头;set5试剂盒(N811)中包含RNA Adapter 96-49至RNA Adapter96-72共计24种不同Index接头;set6试剂盒(N812)中包含RNA Adapter 96-73至RNA Adapter 96-96共计24种不同Index接头。 试剂盒中提供的所有接头都经过严格的质量控制和功能验证,较大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。

序列信息

使用VAHTS® RNA Adapters set3 – set6 for Illumina构建的RNA文库结构如下:

5’ – Universal Adapter – Insert DNA Sequence – RNA Adapter 96-X – 3’

试剂盒中提供的每种RNA Adapter中都包含Universal Adapter,且提供一种Index序列标签,用于高通量测序时区分不同样品。这些RNAAdapter的序列如下:

VAHTS RNA Adapters set3 - set6 for Illumina

IIIIIIII表示8 bp index序列,测序前在Sample Sheet中输入所使用RNA Adapter对应的Index序列即可。各RNA Adapter对应的Index序列如下表所示:

VAHTS RNA Adapters set3 - set6 for Illumina

VAHTS RNA Adapters set3 - set6 for Illumina

VAHTS RNA Adapters set3 - set6 for Illumina

VAHTS RNA Adapters set3 - set6 for Illumina

-20 °C保存。

金畔生物试剂,VAHTS RNA Multiplex Oligos Set1- Set2 for Illumina

VAHTS® RNA Multiplex Oligos Set1- Set2 for Illumina

VAHTS RNA Multiplex Oligos Set1- Set2 for Illumina

VAHTS® RNA Multiplex Oligos set 1 for Illumina是Illumina高通量测序平台文库构建专用试剂盒。每个试剂盒中包含VAHTS RNA Adapter-S for Illumina、8种VAHTS® i5 PCR Primers以及12种VAHTS® i7 PCR Primers。相互配合使用,可用于构建多至384种不同组合的双端Index标记文库。试剂盒中提供的所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,较大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。

VAHTS RNA Multiplex Oligos Set1- Set2 for Illumina

VAHTS RNA Multiplex Oligos Set1- Set2 for Illumina

所有组分-20℃保存。请勿将本品置于温度高于室温的环境中存放。

金畔生物试剂,VAHTS Small RNA Index Primer Kit for Illumina

VAHTS® Small RNA Index Primer Kit for Illumina

VAHTS Small RNA Index Primer Kit for Illumina

VAHTS® Small RNA Index Primer Kit for Illumina是VAHTS® Small RNA Library Prep Kit for Illumina(vazyme#NR801)专用配套试剂盒,包含1种Universal primer和48种不同的small RNA Index primer,可用于48种不同的单端Index标记small RNA文库的制备。试剂盒中提供的所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,较大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。

VAHTS Small RNA Index Primer Kit for Illumina

所有组分-20°C保存。

金畔生物试剂,VAHTS RNA Adapters Set 8 for MGI

VAHTS® RNA Adapters Set 8 for MGI

VAHTS RNA Adapters Set 8 for MGI

VAHTS® RNA Adapters Set 8 for MGI是华大高通量测序平台文库构建专用配套试剂盒,适用于华大高通量测序平台多样品DNA文库构建。Set 8试剂盒(NM208)包含96种不同Index接头。试剂盒中提供的所有接头都经过严格的质量控制和功能验证,较大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。

 

适用范围

VAHTS® Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit for MGI (Vazyme #NRM604)配套专用接头试剂盒。

 

特点

VAHTS RNA Adapters Set 8 for MGI

* NM208-01/02试剂盒中各组分使用方法,建议同色框中接头搭配使用。

VAHTS RNA Adapters Set 8 for MGI

组分

NM208-01

NM208-02

RNA Adapter

10 μl each

40 μl each

VAHTS RNA Adapters Set 8 for MGI

-30 ~ -15℃保存。

金畔生物试剂,Discover-sc Single Cell WGA Kit

Discover-sc® Single Cell WGA Kit 

Discover-sc Single Cell WGA Kit

样本兼容性广 :适用于动植物细胞,细菌或者卵裂球,滋养外胚胎层细胞,精子等样本

高覆盖度 :单细胞基因组扩增后可达到95%以上的覆盖度

高均一度 :可用于>1 Mb的染色体拷贝数变异分析

高保真度 :Phi29 DNA聚合酶的保真度是Taq酶的1000倍

操作简单 :单管反应,操作时间少于10 min,扩增产物无需纯化

Discover-sc Single Cell WGA Kit

高均一度

1. 根据分布在人16条染色体上的管家基因设计引物,以人的单个293细胞全基因组扩增产物为模板进行qPCR反应。结果显示,16对qPCR引物都能正常扩增,且检测到的CT值均在22-28之间,表明Vazyme #N603试剂盒扩增均一性好。

Discover-sc Single Cell WGA Kit

图1.qPCR检测结果

 

2. 使用Vazyme #N603试剂盒对单细胞进行基因组扩增,并使用Vazyme转座酶建库试剂盒(#TD502)构建文库。按照有效浓度及0.01X的测序深度Pooling 后进行Illumina Miniseq测序。下机数据结果显示,reads在基因组各部位分布得比较均匀,表明Vazyme #N603扩增均一性很好,可用于大片段拷贝数变异分析。

Discover-sc Single Cell WGA Kit

图2.全基因组拷贝数散点分布图

高覆盖度

Discover-sc® Single Cell WGA Kit使用优化的反应体系,可以实现单细胞的全基因组扩增,且基因组覆盖度可达95%以上,与Q*及Y*公司同类型产品相比,覆盖度更高,性能更优异。

Discover-sc Single Cell WGA Kit

图3.N603与Q*及Y*公司同类型产品,Coverage Rate对比

指数的扩增原理

Discover-sc Single Cell WGA Kit

 

图4.Phi29 DNA 聚合酶介导的 MDA 示意图

 

简易的操作流程

Discover-sc Single Cell WGA Kit

图5.操作流程示意图

Discover-sc Single Cell WGA Kit

Discover-sc® Single Cell WGA Kit使用基于多重链置换扩增(MDA)的等温扩增体系,启用了定向进化改造的Phi29 DNA聚合酶,具有更高的扩增效率和扩增均一性,能够在2 h内快速实现1-1000个细胞或者微量样本的全基因组无差别扩增。单细胞基因组经N603扩增后可达到95%以上的覆盖度,扩增产物大小在2 – 100 kb之间,平均产物长度大于20 kb,广泛适用于胚胎植入前染色体检测(PGS/PGD)、肿瘤细胞、干细胞、宏基因组学等研究领域。Discover-sc® Single Cell WGA Kit中所有酶和缓冲液都经过了严格的质量控制和功能验证,优化的实验体系较大程度上提升了扩增均一性,保证了稳定性和重复性。

Discover-sc Single Cell WGA Kit

组分 N603-01 (24 rxns) N603-02 (96 rxns)
Discover-sc® WGA Enzyme Mix 48 μl 192 μl
Discover-sc® WGA Master Buffer 750 μl 3 ×1 ml
Buffer D 1 ml 2 ×1 ml
Stop Solution 1 ml 2 ×1 ml
DTT, 1M 1 ml 1 ml
Cell Storage Buffer 1 ml 2 ×1 ml
H2O 1 ml 2 ×1 ml

Discover-sc Single Cell WGA Kit

-30 ~ -15℃保存,如需更长期储存请于-70℃以下存放。