FastSelect rRNA Kit (Human)
锁核酸法rRNA快速去除,助力宏转录病原检测
- 去除人总RNA中的rRNA
- mRNA和非编码RNA分析
- 宏转录组检测
- 快速:一步去除,流程仅需2min
- 兼容:兼容1 ng – 1 µg total RNA,兼容病原样本、FFPE样本
- 高质:高效的rRNA去除,优异的病原检出,严格的背景菌质控
FastSelect rRNA Kit (Human)适用于去除人总RNA中的rRNA(包括细胞质28S、18S、5.8S、5S rRNA,以及线粒体16S、12S rRNA),保留mRNA及其它非编码RNA;该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本(例如FFPE样本),得到的RNA可用于mRNA和非编码RNA(例如IncRNA)分析。该试剂盒能够快速去除人总RNA中的rRNA,操作简便快速,应用于病原微生物检出领域,能够显著提高病原检出。
1. 兼容不同起始量
以293T total RNA为起始模板,投入量分别为1 ng、10 ng、100 ng、1 μg。使用Vazyme #N460以及友商同类产品对rRNA去除后进行建库。通过对高质量的Clean Reads进行分析,结果显示在不同投入量下,Vazyme #N460的rRNA残留率均少于Supplier A,且基因检出数优于Supplier A。说明Vazyme #N460的rRNA去除能力更高,基因检出数更加丰富。
图1. 不同起始量下rRNA残留情况 |
图2. 不同起始量下基因检测数 |
2. 兼容病原样本
将293T、沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、PEDV按500 : 1 : 1 : 10比例模拟临床病原样本,分别以1ng、100ng的模拟样本的total RNA为起始模板,分别使用Vazyme #N460以及Supplier A同类产品进行rRNA去除后,参照Vazyme #UNR605以及Supplier A同类产品进行建库。通过对病原检出进行分析,结果显示Vazyme #N460在1ng和100ng总RNA投入量下进行模拟样本病原检测,掺入的病原均有检出,且三种病原的RPM值均优于Supplier A,显著优于未去除组的病原检出。
图1. 病原样本-1 ng投入量下的病原RPM值 |
图2. 病原样本-100 ng投入量下的病原RPM值 |
3.兼容FFPE样本
以100ng的FFPE样本的total RNA为起始模板,分别使用Vazyme #N460以及Supplier A同类产品进行rRNA去除后,参照Vazyme #UNR605以及Supplier A同类产品进行建库。通过对高质量的Clean Reads进行分析,结果显示针对FFPE样本,Vazyme #N460的rRNA残留率均少于Supplier A,且基因检出数优于Supplier A。说明Vazyme #N460对于FFPE样本的的rRNA去除能力更高,基因检出数更加丰富。
图1. FFPE样本的rRNA残留率 |
图2. FFPE样本的基因检出数 |
组分 |
N460-01 |
N460-02 |
Fast rRNA Removal Mix |
24 μl |
96 μl |
Nuclease-free ddH2O |
1 ml |
4×1 ml |
-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。