金畔生物试剂,Ribo-off Globin & rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-off® Globin & rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

珠蛋白(Globin) mRNA及rRNA去除试剂盒

Ribo-off Globin & rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

低质量RNA样本高效去除效率

起始量低至 10 ng

Ribo-off Globin & rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-off® Globin & rRNA Depletion Kit(Human/Mouse/Rat)是针对血液样本总RNA中去除珠蛋白(Globin)mRNA及rRNA的试剂盒。本试剂盒适用于起始模板量为0.01 – 1 μg的血液总RNA,总RNA样本经过Globin mRNA和rRNA与探针杂交、RNase H消化、DNase I消化等步骤,将Globin mRNA及rRNA(包括细胞质rRNA和线粒体rRNA)从总RNA中去除,保留其它mRNA以及非编码RNA,可用于LncRNA等非编码RNA的分析;本试剂盒可兼容部分降解的RNA样本,所得到的产物适用于RNA文库构建及其它实验。

Ribo-off Globin & rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

1. 不同物种、不同起始量模板

以Human、Mouse 以及 Rat Blood RNA 为起始模板,分别进行不去除和使用 N408、N*公司(#E7***L)、K*公司(K***78)同类产品进行 rRNA 去除,随后均使用 VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(NR605)进行链特异性转录组文库构建。经测序分析rRNA与Globin mRNA在下机数据中的占比。评判指标:rRNA ratio≤5%+1%;Globin mRNA ratio ≤1%+0.5%。
 

不同起始量(Human)

Ribo-off Globin & rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

不同物种(100 ng)

Ribo-off Globin & rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

图1. 不同起始量、不同物种Globin mRNA及rRNA去除情况

结果表明:不同起始量(1 µg-10 ng)、不同物种的样本,N408均能高效去除目标 RNA。

 

2. 不同RIN值模板

以100 ng不同RIN值的Human Blood RNA为起始模板,分别进行不去除和使用N408、N*公司(#E7***L)、K*公司(K***78)和 Q*公司(3***80)同类产品进行 rRNA 去除,随后均使用 VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行链特异性转录组文库构建。经测序分析rRNA与Globin mRNA在下机数据中的占比。

Ribo-off Globin & rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

图2. 不同RIN值样本Globin mRNA及rRNA去除情况

Ribo-off Globin & rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-off Globin & rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

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-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。