KAPA 核糖体去除链方向性RNA文库准备试剂盒

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KAPA 核糖体去除链方向性RNA文库准备试剂盒

为转录组测序提供了一个高质量、完整的解决方案采用酶消化靶序列的方法，该试
剂盒能更好地减少核糖体RNA (rRNA),从而提取更完整的转录组信息，包括mRNA前
体和非编码RNA (ncRNA)。
该试剂盒采用KAPA HiFi酶，用于文库扩增，有高效率、低偏好性的特点。全试剂盒
的工作流程简化，采取”with bead”的操作。

1、产品应用

●高质量和低质量的RNA样本(例如从FFPE组织提取的)基因表达分析。

●单核苷酸变异(SNV)的发现。

●剪接位点和融合基因的识别。

●不带poly尾的RNA的特性分析，包括非编码RNA和前提RNA。

　　2、产品优势

●高达99.98% rRNA去除效率　●起始总RNA范围为100ng～1μg

●适用物种为人、小鼠、大鼠　●不同起始量均能得到可靠的、可重复结果

●工作流程易于实现自动化，已有多种自动平台的对接方案。

　　3、优势表现

1)行业领先的rRNA去除效果。能从FFPE样本中有效去除rRNA减少rRNA reads，测序更经济，转录本测序深度更深

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2)最大的覆盖均一性

●各转录本读序(reads)分布均一

●5’-3’的偏好性小

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3)无与伦比的测序数据质量

●检测更多基因和特定转录本

●准确、清晰地识别剪切位点和选择性剪切基因

●覆盖度高，能更好地检测困难或GC含量高的转录本

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采用KAPA Stranded RNA-Seq Kit with RiboErase工作流程所取得的高质量测序数据，同Illumina、NEB相似试剂盒的对比结果;

KAPA Stranded RNA-Seq Kit with RiboErase的工作流程不仅获得同类别试剂盒同等的测序读序映射率，同时重复率(duplication rates)低，覆盖均一性高，并且检测到更多数量的特异的转录片段和基因，从而使在样本中探测表达基因的灵敏度得到提高。

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GC富集的转录片段的覆盖度提高：

上图显示haemoglobin alpha transcript(HBA1)的测序覆盖度和剪切位点识别情况.HBA1的GC含量为62.8%.图中显示GC含量的轨道行将GC含量高的区域标注为红色.AT含量高的区域标注成蓝色，经过KAPA Stranded RNA-Seq Kit with RiboErase工作流程处理的样本(绿色)，和与同类的Illumina试剂盒(橙色)或NEB试剂盒(蓝色)处理的样本相比，具有更均一的覆盖度，更灵敏的剪切位点识别，并且具有和未经rRNA处理样本(红色)相比更有代表性的数据图形样貌。

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低丰度转录片段的检测率提高：

MALAT1，一个低丰度非编码RNA片段，在文库制备过程中运用KAPA Stranded RNA-Seq Kit with RiboErase(绿色)其片段序列和剪切位点均能够被均一的覆盖，相比之下，使用Illumina-ZeroGold(橙色)和NEBNext(蓝色)的工作流程所得到的该转录片段的覆盖度的均一性较低。

4)可高度重复的测序结果

●即使测试条件不同仍热有很高的相关性

●样本间差异小，结果可靠

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重复样本之间基因表达水平的相关性：以上实验均使用100ng和UHR总RNA作为起始样本。使用KAPA Stranded RNA-Seq Kit with RiboErase的工作流程进行建库时，基因表达水品在重复样本之间显示出非常高的相关性(R2>0.973)高于使用Illumina或NEB同类试剂盒进行建库的情形。

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　　5、产品信息

货号 产品 规格
KK8483 KAPA Stranded RNA Seq Kit with RiboErase (Human/Mouse/Rat)- Ilumina platforms
KAPA链方向性RNA文库准备试剂盒(含核糖体去除) – Ilumina 平台		 24个文库
KK8484 KAPA Stranded RNA Seq Kit with RiboErase (Human/Mouse/Rat)- Ilumina platforms
KAPA链方向性RNA文库准备试剂盒(含核糖体去除)一Illumina 平台		 96个文库
KK8560 KAPA RNA Hyper Kit with RiboErase (Human/Mouse/Rat) -illumina platforms
KAPA RNA Hyper文库构建试剂盒(含核糖体去除) – ilumnina平台		 24个文库
KK8561 KAPA RNA Hyper Kit with RiboErase (Human/Mouse/Rat) -llumina platforms
KAPA RNA Hyper文库构建试剂盒(含核糖体去除)一illumina平 台		 96个文库